111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_27271 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_27271  hypothetical protein  100 
 
 		 715 aa  1464    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21271  hypothetical protein  47.79 
 
 		 484 aa  114  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21281  hypothetical protein  42.36 
 
 		 741 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.419121 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25821  hypothetical protein  46.67 
 
 		 1111 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25851  hypothetical protein  45.83 
 
 		 1121 aa  104  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  38.73 
 
 		 535 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  33.17 
 
 		 535 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 		 1610 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  37.68 
 
 		 1610 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  39.1 
 
 		 1133 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  39.26 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  38.36 
 
 		 2097 aa  80.5  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  33.71 
 
 		 1202 aa  78.2  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  39.04 
 
 		 221 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  35.81 
 
 		 2701 aa  72  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  31.16 
 
 		 648 aa  71.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  30.41 
 
 		 621 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  30.41 
 
 		 621 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  35.34 
 
 		 745 aa  67  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  36.49 
 
 		 2133 aa  65.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 		 2198 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  40.68 
 
 		 515 aa  62  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  31.87 
 
 		 677 aa  61.6  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  36.96 
 
 		 2467 aa  61.2  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  33.09 
 
 		 768 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  34.78 
 
 		 1134 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  36.64 
 
 		 8682 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  36.64 
 
 		 9030 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  28 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  42.7 
 
 		 1394 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  28 
 
 		 475 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  45.57 
 
 		 817 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  41.94 
 
 		 4678 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  47.22 
 
 		 2542 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  49.28 
 
 		 5218 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.28 
 
 		 5962 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  44.74 
 
 		 786 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  40.45 
 
 		 1502 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 		 3184 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  32.62 
 
 		 474 aa  54.3  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  46.67 
 
 		 5444 aa  54.3  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  42.86 
 
 		 1839 aa  53.9  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  32.19 
 
 		 504 aa  53.5  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  30.21 
 
 		 1403 aa  53.5  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  32.45 
 
 		 478 aa  53.9  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  41.44 
 
 		 858 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  40.91 
 
 		 475 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 1764 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  34.13 
 
 		 2251 aa  52.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  32.56 
 
 		 1650 aa  51.6  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33540  hypothetical protein  45.78 
 
 		 340 aa  52  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  43.9 
 
 		 553 aa  51.6  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  39.76 
 
 		 3263 aa  51.2  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  36.36 
 
 		 2768 aa  50.8  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  39.77 
 
 		 475 aa  50.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  41.25 
 
 		 5769 aa  50.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 565 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  30.28 
 
 		 1883 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 465 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  45.83 
 
 		 6753 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  42.65 
 
 		 679 aa  50.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  42.65 
 
 		 585 aa  49.7  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  42.65 
 
 		 582 aa  50.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  41.56 
 
 		 5123 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  32.54 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  28.12 
 
 		 759 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  31.21 
 
 		 476 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  41.46 
 
 		 2743 aa  49.3  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.5 
 
 		 1073 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  48.44 
 
 		 950 aa  48.9  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.4 
 
 		 5839 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  38.89 
 
 		 998 aa  48.9  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  36.59 
 
 		 5442 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  44.16 
 
 		 6211 aa  48.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  43.94 
 
 		 3209 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  43.06 
 
 		 417 aa  47.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  38.46 
 
 		 1168 aa  47.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  36.04 
 
 		 874 aa  47.8  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 2346 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1699 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  31.17 
 
 		 851 aa  47  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  40.96 
 
 		 998 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  39.76 
 
 		 856 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  34.51 
 
 		 542 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4363  putative protease  34.21 
 
 		 110 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  33.91 
 
 		 2704 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  38.54 
 
 		 547 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  56.52 
 
 		 813 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  30.88 
 
 		 479 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  37.04 
 
 		 329 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  37.04 
 
 		 329 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  37.65 
 
 		 2452 aa  45.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.24 
 
 		 1180 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  51.22 
 
 		 1037 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  31.21 
 
 		 946 aa  45.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  36.9 
 
 		 4848 aa  45.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  43.21 
 
 		 1029 aa  45.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.21 
 
 		 1029 aa  45.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  40.22 
 
 		 889 aa  45.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  38.03 
 
 		 1434 aa  44.3  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>