More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51230 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  51.94 
 
 		 1610 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  53.96 
 
 		 1610 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  80.48 
 
 		 1168 aa  774    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  75.61 
 
 		 553 aa  781    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  63.59 
 
 		 1403 aa  1015    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  61.8 
 
 		 998 aa  952    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  54.98 
 
 		 856 aa  847    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  62.5 
 
 		 998 aa  961    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  64.05 
 
 		 1839 aa  1016    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  100 
 
 		 874 aa  1720    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  61.06 
 
 		 532 aa  587  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  56.4 
 
 		 889 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  54.78 
 
 		 858 aa  446  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  54.18 
 
 		 901 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  41.48 
 
 		 515 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1886  hemolysin-type calcium-binding region  37.4 
 
 		 495 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33540  hypothetical protein  39.47 
 
 		 340 aa  183  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.64 
 
 		 1180 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  33.33 
 
 		 855 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  28.43 
 
 		 1480 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  29.28 
 
 		 1156 aa  106  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  29.24 
 
 		 1499 aa  103  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  31.77 
 
 		 3598 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  29.1 
 
 		 2954 aa  102  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.16 
 
 		 1079 aa  94.7  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  27.9 
 
 		 2245 aa  93.6  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  28.32 
 
 		 1164 aa  89  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16670  serralysin-like metalloprotease family protiein  36.84 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  29.34 
 
 		 1400 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  30.79 
 
 		 503 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  30.3 
 
 		 932 aa  83.2  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  32.62 
 
 		 999 aa  82.4  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  28.67 
 
 		 3026 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  27.1 
 
 		 4798 aa  81.6  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  31.36 
 
 		 503 aa  81.3  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.25 
 
 		 946 aa  81.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  29.55 
 
 		 820 aa  80.1  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  32.84 
 
 		 1019 aa  78.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  27.9 
 
 		 3954 aa  78.2  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  34.66 
 
 		 1883 aa  77.8  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  29.95 
 
 		 942 aa  76.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  30.96 
 
 		 462 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  29.03 
 
 		 2198 aa  76.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  28.98 
 
 		 928 aa  76.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.7 
 
 		 1279 aa  75.5  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  27.59 
 
 		 3209 aa  74.7  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  31.46 
 
 		 745 aa  73.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  26.81 
 
 		 5769 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  32.86 
 
 		 1895 aa  73.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  28.57 
 
 		 2911 aa  72.4  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  28.18 
 
 		 648 aa  72.8  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  29.97 
 
 		 621 aa  72.4  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  29.97 
 
 		 621 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  29.19 
 
 		 556 aa  70.5  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.96 
 
 		 2467 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  31.58 
 
 		 833 aa  69.7  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  31 
 
 		 329 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  31 
 
 		 329 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  29.3 
 
 		 518 aa  69.7  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  47.25 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  38.51 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  41.94 
 
 		 786 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  41.94 
 
 		 817 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  27.8 
 
 		 2775 aa  68.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  44.57 
 
 		 759 aa  68.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  34 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  28.85 
 
 		 682 aa  67.8  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.26 
 
 		 2689 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  38.51 
 
 		 476 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  29.22 
 
 		 1544 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  31.94 
 
 		 959 aa  67.4  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  31.42 
 
 		 860 aa  67.4  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  35.12 
 
 		 490 aa  67  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  30.8 
 
 		 727 aa  67  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.09 
 
 		 2678 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  32.19 
 
 		 7284 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  28.6 
 
 		 4334 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  27.87 
 
 		 1197 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  47.19 
 
 		 677 aa  65.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 2107 aa  66.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.48 
 
 		 2807 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  45.68 
 
 		 2524 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.33 
 
 		 3427 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.44 
 
 		 1073 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  28.06 
 
 		 4800 aa  65.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  30.45 
 
 		 622 aa  65.1  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.19 
 
 		 4836 aa  64.7  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  30.09 
 
 		 1421 aa  64.7  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  47.06 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  29.43 
 
 		 1855 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  56.14 
 
 		 713 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  56.14 
 
 		 713 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  41.44 
 
 		 547 aa  63.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  29.66 
 
 		 1037 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  29.6 
 
 		 467 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  33.33 
 
 		 2667 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  47.5 
 
 		 1166 aa  63.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  27.58 
 
 		 2097 aa  63.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  31.65 
 
 		 3619 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  25.33 
 
 		 928 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>