More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51180 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  60.69 
 
 		 856 aa  906    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  61.8 
 
 		 874 aa  934    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  50.46 
 
 		 1610 aa  825    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  85.04 
 
 		 1839 aa  1595    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  50.05 
 
 		 1610 aa  822    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  90.08 
 
 		 998 aa  1692    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  100 
 
 		 998 aa  1928    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  80.33 
 
 		 1403 aa  1287    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  74.39 
 
 		 553 aa  752    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  65.12 
 
 		 532 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  50.08 
 
 		 1168 aa  532  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  56.89 
 
 		 889 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  56.62 
 
 		 901 aa  426  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  55.73 
 
 		 858 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  42.56 
 
 		 515 aa  293  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1886  hemolysin-type calcium-binding region  40.8 
 
 		 495 aa  231  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.81 
 
 		 1180 aa  203  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33540  hypothetical protein  42.72 
 
 		 340 aa  190  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386759  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  29.89 
 
 		 1480 aa  132  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  35.2 
 
 		 946 aa  130  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  29.48 
 
 		 1499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  30.29 
 
 		 3209 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  32.2 
 
 		 1079 aa  129  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  29.34 
 
 		 1156 aa  124  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  33.33 
 
 		 2911 aa  115  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  31.63 
 
 		 3954 aa  114  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.43 
 
 		 3598 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.06 
 
 		 855 aa  111  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  33.27 
 
 		 4334 aa  110  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  28.77 
 
 		 2954 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  29.85 
 
 		 2133 aa  102  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  31.89 
 
 		 2198 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  30.9 
 
 		 1855 aa  100  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  30.68 
 
 		 3026 aa  100  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.78 
 
 		 2807 aa  100  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  36.46 
 
 		 1055 aa  99.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.64 
 
 		 2467 aa  99  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.79 
 
 		 1279 aa  98.6  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  29.79 
 
 		 1582 aa  97.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  30.59 
 
 		 4798 aa  96.7  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  29.59 
 
 		 1534 aa  95.5  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  29.9 
 
 		 1164 aa  95.1  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.01 
 
 		 2775 aa  95.1  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.13 
 
 		 2689 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  30.25 
 
 		 942 aa  93.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  25.69 
 
 		 2245 aa  92.4  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  29 
 
 		 2678 aa  92.8  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  29.4 
 
 		 1532 aa  92.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  31.13 
 
 		 5769 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  31.2 
 
 		 503 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16670  serralysin-like metalloprotease family protiein  36.22 
 
 		 214 aa  89.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  34.73 
 
 		 1019 aa  89.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  30.46 
 
 		 1544 aa  89  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  31.34 
 
 		 503 aa  89  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  33.8 
 
 		 621 aa  88.6  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  33.8 
 
 		 621 aa  88.6  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  31.53 
 
 		 2836 aa  88.2  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 329 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 329 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  31.8 
 
 		 462 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  33.33 
 
 		 648 aa  86.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  32.09 
 
 		 820 aa  86.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  28.72 
 
 		 556 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  31.74 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.36 
 
 		 1363 aa  85.5  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.69 
 
 		 1145 aa  85.1  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.04 
 
 		 1415 aa  84.7  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  33.93 
 
 		 313 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  34.87 
 
 		 999 aa  83.2  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  31.5 
 
 		 1884 aa  83.2  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  27.7 
 
 		 851 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  28.4 
 
 		 928 aa  82.4  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  33.2 
 
 		 2701 aa  81.3  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  28.3 
 
 		 1895 aa  79.7  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  31.76 
 
 		 759 aa  80.1  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  27.51 
 
 		 795 aa  79.7  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  34.02 
 
 		 546 aa  79.7  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  28.81 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  33.47 
 
 		 1883 aa  78.2  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  28.85 
 
 		 1814 aa  78.2  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.25 
 
 		 1197 aa  78.2  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  26.72 
 
 		 4800 aa  77.4  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  29.6 
 
 		 1400 aa  77.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  31.42 
 
 		 3619 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 		 475 aa  76.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  28.94 
 
 		 824 aa  77  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  34.46 
 
 		 3608 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  31.27 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  47.62 
 
 		 2743 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  28.69 
 
 		 682 aa  76.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  29.07 
 
 		 1383 aa  75.5  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  29.86 
 
 		 2107 aa  75.1  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  35.27 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.63 
 
 		 1795 aa  74.3  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  41.83 
 
 		 1202 aa  73.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  30.39 
 
 		 768 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  30.64 
 
 		 437 aa  73.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.81 
 
 		 980 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  31.89 
 
 		 387 aa  73.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  29.5 
 
 		 4687 aa  72.8  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>