85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16670 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_16670  serralysin-like metalloprotease family protiein  100 
 
 
214 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33540  hypothetical protein  88.52 
 
 
340 aa  355  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  39.09 
 
 
856 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  36 
 
 
1839 aa  95.5  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  35.5 
 
 
998 aa  95.5  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  37.43 
 
 
1610 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  36.61 
 
 
1403 aa  92.4  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  35.71 
 
 
998 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  33.5 
 
 
1610 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  35.93 
 
 
1168 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  36.84 
 
 
874 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  35.09 
 
 
858 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  36.48 
 
 
553 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  38.29 
 
 
515 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  35.51 
 
 
532 aa  78.6  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  33.33 
 
 
889 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1886  hemolysin-type calcium-binding region  38.89 
 
 
495 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  35.45 
 
 
901 aa  75.5  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  32.52 
 
 
219 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  45.45 
 
 
1502 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
3954 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  33.33 
 
 
3619 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  33.33 
 
 
3619 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  52.63 
 
 
1394 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  32.43 
 
 
3608 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  33.65 
 
 
219 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  36.08 
 
 
1202 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  40.45 
 
 
485 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  33 
 
 
759 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  50.85 
 
 
1400 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  39.56 
 
 
476 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  40.86 
 
 
2704 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  41.11 
 
 
478 aa  46.2  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  40.7 
 
 
2701 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  41.11 
 
 
474 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  41.18 
 
 
1538 aa  45.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  47.46 
 
 
3314 aa  45.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  39.33 
 
 
260 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  41.77 
 
 
946 aa  45.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  33.86 
 
 
1019 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  46.77 
 
 
851 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  36.36 
 
 
490 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  44.26 
 
 
2542 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  37.17 
 
 
5769 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
1073 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 
1764 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  39.39 
 
 
3229 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  31.82 
 
 
503 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.71 
 
 
1795 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  30.58 
 
 
917 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  29.01 
 
 
7679 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 
589 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  36.46 
 
 
833 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  40.96 
 
 
547 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
526 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  36.36 
 
 
486 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  44.64 
 
 
3587 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  29.23 
 
 
686 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 
523 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.243046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  44.64 
 
 
3587 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  43.75 
 
 
4106 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  36.67 
 
 
709 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  38.67 
 
 
329 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  30.91 
 
 
503 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  34.48 
 
 
4848 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  38.67 
 
 
329 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  37.36 
 
 
417 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  36.27 
 
 
757 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  36.78 
 
 
448 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  33.66 
 
 
421 aa  42.4  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  44.44 
 
 
1055 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  36.26 
 
 
648 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  34.04 
 
 
833 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  41.27 
 
 
395 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  33.88 
 
 
2336 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.93 
 
 
588 aa  41.6  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25851  hypothetical protein  40.7 
 
 
1121 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  45 
 
 
1895 aa  42  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.7 
 
 
1016 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  43.55 
 
 
6753 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25821  hypothetical protein  46.67 
 
 
1111 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  39.73 
 
 
4334 aa  41.6  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  36.26 
 
 
2097 aa  41.6  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  38.38 
 
 
813 aa  41.6  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  36.27 
 
 
2743 aa  41.2  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>