More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3160 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
523 aa  1008    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.243046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.62 
 
 
2346 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.5 
 
 
1284 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  31.17 
 
 
4798 aa  92  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  43.87 
 
 
678 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  33.8 
 
 
999 aa  90.9  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  32.28 
 
 
1480 aa  87.8  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  35.06 
 
 
855 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  35.19 
 
 
1079 aa  84.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  32.77 
 
 
1156 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  32.95 
 
 
2954 aa  84  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  30.6 
 
 
1499 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  30.94 
 
 
3598 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  52.04 
 
 
9030 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  64.06 
 
 
5962 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  33.73 
 
 
5769 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  67.19 
 
 
6753 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  51.02 
 
 
8682 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.12 
 
 
1180 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  57.69 
 
 
5218 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  32.57 
 
 
2245 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  42.19 
 
 
709 aa  77.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  33.08 
 
 
942 aa  77.4  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  42.06 
 
 
1287 aa  77.4  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  41.5 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  54.43 
 
 
4678 aa  73.6  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  32.22 
 
 
3954 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  31.09 
 
 
856 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  32.25 
 
 
515 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  30.94 
 
 
820 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  30.58 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  54.12 
 
 
2542 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  37.5 
 
 
451 aa  72  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.57 
 
 
4220 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.32 
 
 
2689 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  31.25 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  34.57 
 
 
518 aa  70.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  56.16 
 
 
2239 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  28.7 
 
 
1403 aa  70.1  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  33.1 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  33.1 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  30.71 
 
 
2467 aa  70.1  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  30.04 
 
 
1839 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  58.82 
 
 
5787 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.47 
 
 
946 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  56.16 
 
 
6779 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  56.16 
 
 
6683 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  56.16 
 
 
6662 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  50 
 
 
4106 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  52 
 
 
1202 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2542  Hemolysin-type calcium-binding region  28.98 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  42.06 
 
 
938 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  29.86 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  27.94 
 
 
3209 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  30.04 
 
 
998 aa  67.4  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  27.76 
 
 
622 aa  67.4  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  33.58 
 
 
2105 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  53.52 
 
 
2890 aa  67.4  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  58.46 
 
 
4791 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  31.42 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.55 
 
 
1363 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  30.22 
 
 
313 aa  67  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0367  Hemolysin-type calcium-binding region  35.33 
 
 
726 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  30.85 
 
 
767 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  48.81 
 
 
2743 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  24.49 
 
 
4687 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3592  Hemolysin-type calcium-binding region  40.17 
 
 
303 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0868117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  53.33 
 
 
1394 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  51.95 
 
 
2251 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  52.94 
 
 
686 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  48 
 
 
4451 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4494  Hemolysin-type calcium-binding region  37.4 
 
 
497 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  0.131139 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  31.36 
 
 
824 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.05 
 
 
2812 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  42.86 
 
 
513 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  30.99 
 
 
491 aa  65.1  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  27.78 
 
 
313 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  30.26 
 
 
341 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4126  hemolysin-type calcium-binding region  37.4 
 
 
497 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  48 
 
 
7072 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  38.1 
 
 
260 aa  64.7  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  28.36 
 
 
860 aa  64.7  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1927  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 
108 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419992  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  55.56 
 
 
589 aa  64.3  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  31.89 
 
 
7149 aa  64.3  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  51.25 
 
 
448 aa  64.3  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  46.05 
 
 
1166 aa  64.3  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.58 
 
 
1795 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.81 
 
 
5839 aa  64.3  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  38.89 
 
 
219 aa  63.9  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  50 
 
 
4285 aa  63.9  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  46.23 
 
 
1421 aa  63.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  58.18 
 
 
2775 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  59.26 
 
 
1712 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  34.62 
 
 
1855 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  28.17 
 
 
959 aa  63.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  49.32 
 
 
504 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  29.12 
 
 
727 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 
16322 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  51.39 
 
 
202 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>