More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3664 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
678 aa  1373    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1347  phosphoesterase PA-phosphatase related  52.91 
 
 
513 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2488  hypothetical protein  37.23 
 
 
493 aa  322  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2561  hypothetical protein  35.91 
 
 
480 aa  257  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2995  hypothetical protein  28.87 
 
 
667 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617304  hitchhiker  0.00000029866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2161  hypothetical protein  28.2 
 
 
870 aa  197  7e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.87 
 
 
5216 aa  145  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2325  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.91 
 
 
426 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3033  hypothetical protein  26.01 
 
 
440 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.715848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  44.52 
 
 
523 aa  91.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.243046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6085  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.11 
 
 
449 aa  91.3  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4735  phosphoesterase PA-phosphatase related  22.91 
 
 
452 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.829288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  43.17 
 
 
2145 aa  84.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4663  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.23 
 
 
515 aa  84.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626418  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  37.16 
 
 
2105 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.49 
 
 
2668 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  36.62 
 
 
9867 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.16 
 
 
1795 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  42.28 
 
 
8682 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  42.15 
 
 
6753 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4523  phosphoesterase PA-phosphatase related  22.85 
 
 
421 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  42.28 
 
 
9030 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
303 aa  80.1  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  33.71 
 
 
260 aa  80.1  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  36.96 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1087  hemolysin-type calcium-binding region  40.6 
 
 
195 aa  78.2  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.57 
 
 
980 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  51.35 
 
 
5218 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.68 
 
 
5962 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  36.91 
 
 
460 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  37.14 
 
 
507 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  37.14 
 
 
686 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  29.27 
 
 
2704 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41.3 
 
 
517 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  37.58 
 
 
460 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  32.9 
 
 
999 aa  75.9  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  22.26 
 
 
451 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  41.67 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  34.07 
 
 
1306 aa  75.1  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  38.17 
 
 
709 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6726  hypothetical protein  24.76 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0771902  normal  0.314379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  37.86 
 
 
615 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0022  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.81 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.13 
 
 
1016 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  49.32 
 
 
2542 aa  73.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  33.95 
 
 
1480 aa  73.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  40.78 
 
 
4106 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  34.01 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3504  chloride peroxidase  27.11 
 
 
598 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.46 
 
 
1236 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  29.53 
 
 
2537 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 
475 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3592  Hemolysin-type calcium-binding region  41.04 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0868117 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.16 
 
 
2678 aa  71.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  34 
 
 
475 aa  71.2  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  49.32 
 
 
4678 aa  70.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  36.29 
 
 
1394 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.67 
 
 
2346 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  30.24 
 
 
820 aa  70.1  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  34.84 
 
 
526 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  38.84 
 
 
982 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  37.69 
 
 
510 aa  69.7  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  46.15 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5242  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.31 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  39.47 
 
 
1166 aa  69.7  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0367  Hemolysin-type calcium-binding region  35.77 
 
 
726 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
2885 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  41.35 
 
 
2452 aa  68.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  35 
 
 
757 aa  68.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.11 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  31.93 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  36.79 
 
 
547 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 
1287 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  38.54 
 
 
1502 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  40 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  36.69 
 
 
1079 aa  67.8  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  36.21 
 
 
485 aa  67.8  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  50.72 
 
 
2296 aa  67.8  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  32.41 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  39.13 
 
 
2775 aa  67.8  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  32.41 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.21 
 
 
1553 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  36.59 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.75 
 
 
2667 aa  67.4  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  35.11 
 
 
606 aa  67.4  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  31.93 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  40.59 
 
 
1424 aa  67.4  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  37.69 
 
 
1346 aa  67.4  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  35.48 
 
 
1499 aa  67  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  43.68 
 
 
7679 aa  67  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1609  hypothetical protein  27.85 
 
 
433 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  39.13 
 
 
1712 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.77 
 
 
1279 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  35.92 
 
 
3619 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.41 
 
 
1372 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  35.21 
 
 
3619 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 
329 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1660  phosphoesterase, PA-phosphatase related  22.38 
 
 
407 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  41.49 
 
 
3314 aa  65.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>