18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2161 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2161  hypothetical protein  100 
 
 		 870 aa  1767    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2995  hypothetical protein  45.02 
 
 		 667 aa  518  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617304  hitchhiker  0.00000029866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  28.43 
 
 		 678 aa  190  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1347  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.22 
 
 		 513 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2488  hypothetical protein  27.93 
 
 		 493 aa  120  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2561  hypothetical protein  26.96 
 
 		 480 aa  102  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.9 
 
 		 5216 aa  65.1  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2325  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.01 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5972  hypothetical protein  27.38 
 
 		 471 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4735  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.09 
 
 		 452 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.829288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6085  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.35 
 
 		 449 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3033  hypothetical protein  37.37 
 
 		 440 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.715848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0022  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.61 
 
 		 520 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.35 
 
 		 451 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4739  vanadium-dependent haloperoxidase family protein  34.78 
 
 		 434 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6726  hypothetical protein  34.34 
 
 		 441 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0771902  normal  0.314379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3504  chloride peroxidase  30.09 
 
 		 598 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4663  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.68 
 
 		 515 aa  44.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>