16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2995 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2995  hypothetical protein  100 
 
 
667 aa  1377    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617304  hitchhiker  0.00000029866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2161  hypothetical protein  45.02 
 
 
870 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  28.87 
 
 
678 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2561  hypothetical protein  35.48 
 
 
480 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1347  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.38 
 
 
513 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2488  hypothetical protein  41.46 
 
 
493 aa  89.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4735  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.25 
 
 
452 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.829288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.28 
 
 
451 aa  58.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6726  hypothetical protein  31.78 
 
 
441 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0771902  normal  0.314379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3033  hypothetical protein  32.71 
 
 
440 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.715848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5972  hypothetical protein  28.67 
 
 
471 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2325  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.7 
 
 
426 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.04 
 
 
5216 aa  47.8  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0022  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.04 
 
 
520 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6085  phosphoesterase PA-phosphatase related  30 
 
 
449 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4739  vanadium-dependent haloperoxidase family protein  32.22 
 
 
434 aa  43.9  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.406685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>