35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0022 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4663  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  63.89 
 
 
515 aa  650    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626418  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0022  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
520 aa  1076    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4660  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  43.38 
 
 
502 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.673229  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.76 
 
 
5216 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6085  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.47 
 
 
449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2325  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.98 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1749  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  28.46 
 
 
403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3033  hypothetical protein  31.91 
 
 
440 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.715848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1347  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.91 
 
 
513 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05520  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.28 
 
 
308 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000494508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  24.88 
 
 
451 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2488  hypothetical protein  27.6 
 
 
493 aa  97.8  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1740  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.44 
 
 
431 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6726  hypothetical protein  30.59 
 
 
441 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0771902  normal  0.314379 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2561  hypothetical protein  26.87 
 
 
480 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4735  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.53 
 
 
452 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.829288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1609  hypothetical protein  31.98 
 
 
433 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5972  hypothetical protein  25.25 
 
 
471 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4523  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.35 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4739  vanadium-dependent haloperoxidase family protein  25.26 
 
 
434 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  23.81 
 
 
678 aa  74.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1660  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.32 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3504  chloride peroxidase  24.95 
 
 
598 aa  73.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1698  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.42 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00849599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5242  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.28 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.41 
 
 
246 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2161  hypothetical protein  37.61 
 
 
870 aa  47.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2900  hypothetical protein  25.93 
 
 
473 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2995  hypothetical protein  33.04 
 
 
667 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617304  hitchhiker  0.00000029866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00690  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase  28.36 
 
 
253 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1631  acid phosphatase  28.32 
 
 
253 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4217  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.53 
 
 
384 aa  45.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5780  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.03 
 
 
430 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313383  normal  0.564601 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03461  acid phosphatase  27.87 
 
 
285 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  26.84 
 
 
279 aa  43.5  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>