28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5972 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5972  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  974    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6085  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.56 
 
 
449 aa  306  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.82 
 
 
451 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1609  hypothetical protein  36.04 
 
 
433 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4735  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.1 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.829288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6726  hypothetical protein  30.62 
 
 
441 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0771902  normal  0.314379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4739  vanadium-dependent haloperoxidase family protein  30.5 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3033  hypothetical protein  28.47 
 
 
440 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.715848 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.38 
 
 
5216 aa  114  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1660  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.21 
 
 
407 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4663  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.01 
 
 
515 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626418  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1740  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.45 
 
 
431 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2325  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.86 
 
 
426 aa  97.1  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1698  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.92 
 
 
411 aa  96.7  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00849599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2488  hypothetical protein  26.62 
 
 
493 aa  94.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2561  hypothetical protein  31.06 
 
 
480 aa  94  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1347  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.11 
 
 
513 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4523  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.53 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1749  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  25.22 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0022  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.25 
 
 
520 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5242  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.46 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3504  chloride peroxidase  24.15 
 
 
598 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  25.31 
 
 
678 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2161  hypothetical protein  27.38 
 
 
870 aa  56.6  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2995  hypothetical protein  28.67 
 
 
667 aa  53.5  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617304  hitchhiker  0.00000029866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2900  hypothetical protein  29.85 
 
 
473 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4660  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.98 
 
 
502 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.673229  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05520  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.38 
 
 
308 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000494508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>