More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0412 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 510 aa  954    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.54 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  50.35 
 
 		 1079 aa  104  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  41.28 
 
 		 2667 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  43.29 
 
 		 313 aa  93.6  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.28 
 
 		 1236 aa  93.6  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  43.29 
 
 		 313 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  40.12 
 
 		 2885 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  44.38 
 
 		 219 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  41.24 
 
 		 460 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42.61 
 
 		 219 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  35.08 
 
 		 1712 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.65 
 
 		 2668 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  34.55 
 
 		 2775 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  39.56 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  30.93 
 
 		 611 aa  84.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  39.56 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  50.83 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  52.63 
 
 		 561 aa  83.6  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  49.54 
 
 		 202 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.68 
 
 		 1795 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  49.54 
 
 		 202 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  38.1 
 
 		 2105 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  40.32 
 
 		 757 aa  82.4  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  41.29 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  45.24 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  39.53 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.79 
 
 		 5839 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  30.32 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  48.45 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  54.35 
 
 		 2704 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  45.3 
 
 		 6753 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  44.92 
 
 		 4106 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  43.61 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.29 
 
 		 1180 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  48.82 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  46.46 
 
 		 686 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.42 
 
 		 2239 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  49.14 
 
 		 1699 aa  77.4  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  31.41 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  48.82 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  42.42 
 
 		 6662 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  42.42 
 
 		 6779 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.42 
 
 		 6683 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  43.59 
 
 		 8682 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  51.46 
 
 		 1164 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.73 
 
 		 1963 aa  74.7  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  43.59 
 
 		 9030 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  49.49 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  48.11 
 
 		 652 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  37.84 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2197  beta-Ig-H3/fasciclin  32.6 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  40.41 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  42.54 
 
 		 3619 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  42.54 
 
 		 3619 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  50.96 
 
 		 1895 aa  73.6  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1087  hemolysin-type calcium-binding region  41.46 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  41.94 
 
 		 813 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  41.3 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  41.73 
 
 		 606 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  47.12 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.88 
 
 		 5962 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.41 
 
 		 2678 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.88 
 
 		 4836 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  49.5 
 
 		 867 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 980 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  43.22 
 
 		 1175 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  42.59 
 
 		 709 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  46.43 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  34.84 
 
 		 1346 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  44.79 
 
 		 9867 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  37.43 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  42.31 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  57.58 
 
 		 2329 aa  70.9  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 		 1022 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 		 1017 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  49.46 
 
 		 3608 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  44.14 
 
 		 1839 aa  70.1  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  45.63 
 
 		 1383 aa  70.1  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  52.33 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  28.61 
 
 		 4798 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  48.89 
 
 		 3209 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  48.31 
 
 		 5218 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1354  hypothetical protein  36.67 
 
 		 359 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  37.37 
 
 		 998 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  39.05 
 
 		 998 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  40.77 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  38.82 
 
 		 5171 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  42.42 
 
 		 2542 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  43.08 
 
 		 387 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.59 
 
 		 588 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  37.69 
 
 		 678 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  53.75 
 
 		 855 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  40.44 
 
 		 709 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  51.76 
 
 		 4678 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  36 
 
 		 686 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0450  beta-Ig-H3/fasciclin  34.87 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.23 
 
 		 4122 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  36.47 
 
 		 2145 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.5 
 
 		 3427 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>