More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3766 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  100 
 
 		 1166 aa  2270    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  64.5 
 
 		 5787 aa  478  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  69.33 
 
 		 1806 aa  217  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  65.27 
 
 		 1350 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  41.29 
 
 		 4854 aa  146  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  31.12 
 
 		 2336 aa  140  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  34.69 
 
 		 5444 aa  127  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.75 
 
 		 4836 aa  126  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  44.58 
 
 		 4106 aa  119  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.77 
 
 		 2812 aa  118  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.53 
 
 		 5839 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  26.63 
 
 		 3191 aa  113  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.77 
 
 		 5962 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  44.97 
 
 		 5218 aa  111  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  43.09 
 
 		 542 aa  110  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  46.46 
 
 		 6779 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.46 
 
 		 6683 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  46.46 
 
 		 6662 aa  108  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  44.44 
 
 		 8682 aa  108  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.46 
 
 		 2239 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  43.79 
 
 		 9030 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  38.49 
 
 		 2452 aa  105  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  42.04 
 
 		 16322 aa  105  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  45.7 
 
 		 2768 aa  105  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  40.96 
 
 		 2704 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  42.38 
 
 		 4285 aa  102  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  46.67 
 
 		 5442 aa  101  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  41.03 
 
 		 2542 aa  101  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.39 
 
 		 4122 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  50.93 
 
 		 686 aa  99.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  46.4 
 
 		 4678 aa  100  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  42.39 
 
 		 1598 aa  99.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  44.38 
 
 		 1883 aa  99.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  43.42 
 
 		 4214 aa  99.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  36.55 
 
 		 3314 aa  98.6  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  35.57 
 
 		 8321 aa  98.2  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  42.48 
 
 		 6753 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  45.22 
 
 		 4791 aa  96.3  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.07 
 
 		 4220 aa  93.6  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 2067 aa  88.2  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  48.6 
 
 		 2251 aa  85.1  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  52.5 
 
 		 7149 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  44.17 
 
 		 3184 aa  84.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.25 
 
 		 1553 aa  84  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  46.96 
 
 		 202 aa  82.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  46.96 
 
 		 202 aa  82.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.98 
 
 		 2346 aa  82  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  29.73 
 
 		 4848 aa  82  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  41.3 
 
 		 1428 aa  80.9  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  52.17 
 
 		 589 aa  81.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1495  von Willebrand factor type A  35.06 
 
 		 2478 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  29.43 
 
 		 5745 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  41.26 
 
 		 2524 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  43.48 
 
 		 260 aa  79.3  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  46.53 
 
 		 682 aa  79  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  47.19 
 
 		 1526 aa  78.6  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  45.28 
 
 		 709 aa  78.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  46.22 
 
 		 3091 aa  78.6  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.44 
 
 		 485 aa  77.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  43.97 
 
 		 375 aa  77.4  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.23 
 
 		 588 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  45.08 
 
 		 219 aa  77  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  52.81 
 
 		 421 aa  77.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.17 
 
 		 1016 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  61.19 
 
 		 1424 aa  76.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.45 
 
 		 2678 aa  76.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  48.6 
 
 		 460 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  44.34 
 
 		 1287 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  47.62 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  40.77 
 
 		 3619 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  50.6 
 
 		 1538 aa  76.3  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  54.93 
 
 		 2667 aa  75.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  29.93 
 
 		 2555 aa  75.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  60.29 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  43.24 
 
 		 813 aa  75.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.47 
 
 		 1795 aa  75.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.21 
 
 		 980 aa  75.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  31.82 
 
 		 1421 aa  75.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  45.63 
 
 		 1019 aa  75.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  55.7 
 
 		 4798 aa  75.9  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  49.47 
 
 		 2105 aa  75.5  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  35.33 
 
 		 3229 aa  75.5  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  46.67 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  40.83 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  52.78 
 
 		 3427 aa  75.1  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  53.09 
 
 		 1499 aa  75.1  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.66 
 
 		 2668 aa  75.1  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  53.09 
 
 		 1156 aa  74.7  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  55.26 
 
 		 1532 aa  74.7  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  44.44 
 
 		 1202 aa  74.7  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  41.8 
 
 		 3619 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  28.55 
 
 		 4978 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 		 615 aa  74.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  53.75 
 
 		 679 aa  74.3  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  40.83 
 
 		 313 aa  74.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  50.67 
 
 		 2329 aa  73.6  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  43.24 
 
 		 3209 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  45.65 
 
 		 786 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  53.66 
 
 		 946 aa  73.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  53.52 
 
 		 2537 aa  73.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>