More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1161 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 2537 aa  4962    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1495  von Willebrand factor type A  42.25 
 
 		 2478 aa  177  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  34.22 
 
 		 1538 aa  98.2  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.22 
 
 		 5098 aa  94.4  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.88 
 
 		 3038 aa  94  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  33.48 
 
 		 2329 aa  92.8  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  57.33 
 
 		 4106 aa  88.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  40 
 
 		 3314 aa  87  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  45.38 
 
 		 572 aa  84.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  56 
 
 		 2704 aa  84  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.68 
 
 		 4334 aa  83.2  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  52 
 
 		 589 aa  83.2  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  47.73 
 
 		 2784 aa  82.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.38 
 
 		 3427 aa  82  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.46 
 
 		 2678 aa  81.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  39.89 
 
 		 2885 aa  80.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  44.67 
 
 		 946 aa  80.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  53.95 
 
 		 938 aa  80.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  41.18 
 
 		 3091 aa  80.5  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  40.56 
 
 		 824 aa  80.5  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  47.33 
 
 		 1424 aa  80.1  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.63 
 
 		 1236 aa  80.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  43.81 
 
 		 4791 aa  79.7  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  43.8 
 
 		 2667 aa  79.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  55.7 
 
 		 855 aa  78.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.5 
 
 		 980 aa  78.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  42.67 
 
 		 2251 aa  78.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  35.58 
 
 		 2296 aa  78.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  53.92 
 
 		 1534 aa  77.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.76 
 
 		 4220 aa  77.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  37.87 
 
 		 1141 aa  77.4  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  39.1 
 
 		 504 aa  77  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  40.13 
 
 		 1814 aa  77  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.03 
 
 		 485 aa  77  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  48.57 
 
 		 260 aa  77  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2337  hypothetical protein  36.3 
 
 		 1035 aa  77  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  56 
 
 		 5839 aa  76.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.45 
 
 		 1963 aa  76.6  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  51.96 
 
 		 1532 aa  76.3  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  43.06 
 
 		 1855 aa  75.9  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  45.28 
 
 		 709 aa  75.9  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  48.55 
 
 		 1884 aa  75.9  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  50.55 
 
 		 1499 aa  75.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  57.53 
 
 		 589 aa  75.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  49.56 
 
 		 202 aa  75.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  49.56 
 
 		 202 aa  75.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  50 
 
 		 760 aa  75.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  48.11 
 
 		 4687 aa  75.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  46.36 
 
 		 1156 aa  74.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.37 
 
 		 421 aa  74.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  56.52 
 
 		 1055 aa  74.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  51.14 
 
 		 1526 aa  75.1  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  46.77 
 
 		 2954 aa  74.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1306 aa  75.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  41.01 
 
 		 3954 aa  75.1  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  40.65 
 
 		 257 aa  74.7  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  40.94 
 
 		 959 aa  75.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  53.95 
 
 		 1582 aa  74.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.25 
 
 		 11716 aa  74.3  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  65 
 
 		 2911 aa  73.6  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  46.81 
 
 		 622 aa  73.9  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  58.67 
 
 		 556 aa  73.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  40.97 
 
 		 820 aa  73.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  46.58 
 
 		 421 aa  73.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 385 aa  73.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  53.52 
 
 		 1166 aa  73.6  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  46.3 
 
 		 679 aa  73.6  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 		 588 aa  73.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  41.78 
 
 		 1164 aa  73.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  59.42 
 
 		 782 aa  73.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.78 
 
 		 2346 aa  72.8  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.43 
 
 		 1795 aa  72.8  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  38.78 
 
 		 3619 aa  72.8  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.78 
 
 		 1553 aa  72  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  56.72 
 
 		 2452 aa  72  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  51.35 
 
 		 867 aa  72.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  29.53 
 
 		 678 aa  72  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  57.53 
 
 		 2105 aa  72.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  33.33 
 
 		 686 aa  72.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  38.1 
 
 		 3619 aa  72  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  37.4 
 
 		 615 aa  71.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  48.1 
 
 		 851 aa  71.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  50.67 
 
 		 744 aa  72  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  46.3 
 
 		 795 aa  71.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  36.7 
 
 		 1022 aa  71.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  36.7 
 
 		 1017 aa  71.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  42.98 
 
 		 813 aa  71.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  52.05 
 
 		 998 aa  71.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  54.79 
 
 		 833 aa  71.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.64 
 
 		 2668 aa  71.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.06 
 
 		 1016 aa  70.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  47.9 
 
 		 518 aa  71.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  38.36 
 
 		 717 aa  71.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.43 
 
 		 1363 aa  70.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  44.44 
 
 		 1197 aa  70.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  50.65 
 
 		 1112 aa  70.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  43 
 
 		 16322 aa  70.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  56.72 
 
 		 2768 aa  70.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  48.05 
 
 		 769 aa  70.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  46.3 
 
 		 582 aa  70.5  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>