More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5074 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
782 aa  1568    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  81.1 
 
 
781 aa  1254    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5018  Hemolysin-type calcium-binding region  79.18 
 
 
763 aa  1215    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0553928  normal  0.0814089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  51.95 
 
 
713 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  51.71 
 
 
713 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  34.83 
 
 
1538 aa  88.2  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  46.34 
 
 
1424 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  46.15 
 
 
1526 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  43.85 
 
 
2182 aa  80.9  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.4 
 
 
3427 aa  80.9  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  48.65 
 
 
2885 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  43.44 
 
 
2667 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  50 
 
 
2342 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  50 
 
 
2342 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  55.56 
 
 
5839 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  40.94 
 
 
1145 aa  77.8  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.96 
 
 
2678 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  44.86 
 
 
3587 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  42.25 
 
 
518 aa  76.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  48.45 
 
 
1582 aa  75.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  52.5 
 
 
161 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  46.22 
 
 
2911 aa  75.5  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.56 
 
 
1236 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  42.45 
 
 
2775 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  38.66 
 
 
785 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  59.42 
 
 
2537 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  47.25 
 
 
2178 aa  73.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  56.92 
 
 
998 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  51.09 
 
 
3619 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  42.55 
 
 
855 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  54.55 
 
 
639 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  51.09 
 
 
3619 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  53.25 
 
 
2296 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.47 
 
 
1180 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  45.56 
 
 
7284 aa  72  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  55.42 
 
 
950 aa  72.4  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  46.81 
 
 
744 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  55 
 
 
589 aa  72.4  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  42.75 
 
 
3091 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.74 
 
 
1372 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  44.34 
 
 
959 aa  71.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  46.39 
 
 
1534 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  33.88 
 
 
686 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  47.17 
 
 
2950 aa  71.2  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  56.52 
 
 
1712 aa  71.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1699  hypothetical protein  36.62 
 
 
593 aa  70.9  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00360282  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.44 
 
 
1963 aa  70.9  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  61.82 
 
 
4106 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  45.79 
 
 
860 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  34.93 
 
 
615 aa  70.5  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.68 
 
 
2346 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
357 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  51.72 
 
 
686 aa  70.5  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  51.95 
 
 
709 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  47.22 
 
 
1421 aa  69.7  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  59.42 
 
 
2954 aa  70.1  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  42.61 
 
 
589 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  40.54 
 
 
556 aa  69.7  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  52.44 
 
 
2105 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  52.5 
 
 
3954 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  55.22 
 
 
3608 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  43.41 
 
 
1112 aa  68.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  51.39 
 
 
2329 aa  69.3  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  39.82 
 
 
760 aa  68.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  34.55 
 
 
717 aa  68.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  41.59 
 
 
1480 aa  68.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  42.11 
 
 
942 aa  69.3  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  64.62 
 
 
1814 aa  69.3  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  58.46 
 
 
813 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  41.48 
 
 
1895 aa  68.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  57.81 
 
 
1055 aa  68.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  42.11 
 
 
2887 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  53.85 
 
 
2704 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.21 
 
 
868 aa  68.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  59.38 
 
 
1019 aa  68.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  54.79 
 
 
4687 aa  67.8  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  51.32 
 
 
1532 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  51.95 
 
 
1883 aa  67.8  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  48.89 
 
 
686 aa  67.8  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  50.65 
 
 
1553 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  38.99 
 
 
510 aa  67.8  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  51.81 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  60 
 
 
2452 aa  67.4  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  51.61 
 
 
7679 aa  67  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  48.81 
 
 
387 aa  67  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  60.94 
 
 
1462 aa  67  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  48.94 
 
 
928 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  61.82 
 
 
3314 aa  67.4  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  44.86 
 
 
3587 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.25 
 
 
980 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  61.67 
 
 
6753 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.16 
 
 
1795 aa  67  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  60 
 
 
8682 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02754  hypothetical protein  59.7 
 
 
236 aa  66.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  54.43 
 
 
221 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  55.93 
 
 
1699 aa  66.6  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  53.62 
 
 
5962 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
467 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  48.31 
 
 
2251 aa  66.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>