More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1087 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 5098 aa  10030    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  29.42 
 
 		 2329 aa  592  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  28.03 
 
 		 4748 aa  376  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  26.11 
 
 		 7233 aa  298  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  27.81 
 
 		 2042 aa  214  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  59.87 
 
 		 3396 aa  197  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1050  hypothetical protein  63.83 
 
 		 314 aa  192  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  27.19 
 
 		 2127 aa  189  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  29.13 
 
 		 2542 aa  179  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  55.8 
 
 		 6715 aa  171  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.51 
 
 		 1553 aa  150  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  34.04 
 
 		 2251 aa  135  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  32.11 
 
 		 16311 aa  129  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  30.46 
 
 		 3182 aa  125  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  27.4 
 
 		 5171 aa  124  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.16 
 
 		 1800 aa  112  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.36 
 
 		 1599 aa  108  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1538 aa  108  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  28.05 
 
 		 3259 aa  107  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  26.11 
 
 		 3229 aa  107  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.19 
 
 		 2067 aa  106  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  35.2 
 
 		 2887 aa  105  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  28.41 
 
 		 4848 aa  103  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  34.01 
 
 		 2524 aa  102  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.9 
 
 		 11716 aa  102  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.07 
 
 		 1340 aa  101  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  42.22 
 
 		 2537 aa  94.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  28.12 
 
 		 2768 aa  94.4  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.05 
 
 		 4334 aa  92  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  36.23 
 
 		 1855 aa  91.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  52.22 
 
 		 2784 aa  90.9  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  48.15 
 
 		 3091 aa  89.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  42.25 
 
 		 1141 aa  86.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  36.67 
 
 		 3314 aa  85.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  27.13 
 
 		 2337 aa  84.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  38.5 
 
 		 2954 aa  84.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.24 
 
 		 3038 aa  84.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  25.34 
 
 		 1029 aa  84  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.17 
 
 		 1661 aa  83.6  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  33.05 
 
 		 3714 aa  83.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.5 
 
 		 1029 aa  82.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  35.86 
 
 		 1814 aa  82.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.25 
 
 		 3427 aa  82.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  34.97 
 
 		 6310 aa  82  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  34.36 
 
 		 8064 aa  81.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.38 
 
 		 485 aa  81.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  41.98 
 
 		 1526 aa  81.3  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  39.33 
 
 		 1019 aa  81.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.48 
 
 		 1222 aa  81.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.73 
 
 		 980 aa  80.5  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  45.45 
 
 		 757 aa  80.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  34.36 
 
 		 5451 aa  80.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  41.32 
 
 		 161 aa  79.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.88 
 
 		 1363 aa  79.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  38.58 
 
 		 4106 aa  79  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  32.1 
 
 		 3508 aa  79  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.23 
 
 		 2194 aa  79  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  56 
 
 		 1712 aa  78.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  35.26 
 
 		 3923 aa  78.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.52 
 
 		 588 aa  79  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  34.59 
 
 		 243 aa  78.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  41.55 
 
 		 938 aa  78.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.17 
 
 		 421 aa  77.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  48.18 
 
 		 202 aa  77.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  37.5 
 
 		 475 aa  77.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  48.18 
 
 		 202 aa  77.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  48 
 
 		 813 aa  77.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.76 
 
 		 1963 aa  77.4  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1846  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.62 
 
 		 4876 aa  77  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  43 
 
 		 475 aa  77  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003092  hypothetical protein  45.95 
 
 		 236 aa  76.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0245591  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  37.71 
 
 		 1534 aa  76.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  35.06 
 
 		 5218 aa  75.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  46.08 
 
 		 2567 aa  75.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  47.62 
 
 		 959 aa  75.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.43 
 
 		 2668 aa  75.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  40.54 
 
 		 1532 aa  75.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  45.36 
 
 		 589 aa  75.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  34.12 
 
 		 7149 aa  75.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.28 
 
 		 5839 aa  75.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  55.42 
 
 		 942 aa  75.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  45.76 
 
 		 3619 aa  75.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  45.76 
 
 		 3619 aa  74.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  26.05 
 
 		 4661 aa  74.7  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  40.4 
 
 		 2105 aa  73.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  40.57 
 
 		 615 aa  73.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  37.95 
 
 		 1055 aa  73.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  37.5 
 
 		 2625 aa  73.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  35.47 
 
 		 2743 aa  73.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.55 
 
 		 2346 aa  72.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.62 
 
 		 1424 aa  73.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  44.92 
 
 		 3608 aa  73.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  53.16 
 
 		 504 aa  73.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  42.96 
 
 		 1421 aa  73.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  52.94 
 
 		 1499 aa  72.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  47.62 
 
 		 860 aa  72.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  48.24 
 
 		 1383 aa  72.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  50 
 
 		 998 aa  72.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.91 
 
 		 1795 aa  72.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.65 
 
 		 1225 aa  72  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>