254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4138 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  40.27 
 
 		 3229 aa  696    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  80.46 
 
 		 1599 aa  1444    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  100 
 
 		 3182 aa  6062    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.24 
 
 		 1553 aa  580  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  52.7 
 
 		 3259 aa  553  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.01 
 
 		 2067 aa  521  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  29.01 
 
 		 4285 aa  499  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  32.58 
 
 		 3714 aa  475  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  29.06 
 
 		 4661 aa  462  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  30.1 
 
 		 3508 aa  352  7e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  28 
 
 		 2524 aa  321  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  28.55 
 
 		 2887 aa  307  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  25.6 
 
 		 2567 aa  294  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.76 
 
 		 4122 aa  278  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.46 
 
 		 3191 aa  264  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  25.23 
 
 		 2784 aa  260  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  25.09 
 
 		 5020 aa  259  8e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.79 
 
 		 5745 aa  251  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.34 
 
 		 4836 aa  250  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  28 
 
 		 16311 aa  236  8.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  26.45 
 
 		 4978 aa  205  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  28.9 
 
 		 1883 aa  202  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  26.49 
 
 		 8321 aa  194  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  32.69 
 
 		 1706 aa  194  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  24.72 
 
 		 3758 aa  190  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.82 
 
 		 2812 aa  179  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.76 
 
 		 2812 aa  177  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.71 
 
 		 5839 aa  175  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.84 
 
 		 2239 aa  173  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  24.27 
 
 		 3439 aa  171  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  49.55 
 
 		 6779 aa  169  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  49.55 
 
 		 6662 aa  169  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.55 
 
 		 6683 aa  168  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  47.83 
 
 		 5442 aa  165  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  48.26 
 
 		 4791 aa  165  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  27.87 
 
 		 2555 aa  164  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  42.2 
 
 		 2768 aa  159  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  25.01 
 
 		 4854 aa  154  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.95 
 
 		 4220 aa  150  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.21 
 
 		 5787 aa  150  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  26.48 
 
 		 3091 aa  149  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  25.94 
 
 		 8871 aa  140  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  55.3 
 
 		 7149 aa  140  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.55 
 
 		 1884 aa  134  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  58.09 
 
 		 16322 aa  130  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  27 
 
 		 1597 aa  128  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  28.49 
 
 		 2743 aa  128  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  37.7 
 
 		 2251 aa  124  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  47.3 
 
 		 5444 aa  121  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  29.53 
 
 		 2127 aa  121  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.95 
 
 		 14916 aa  121  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.94 
 
 		 5098 aa  119  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  25.34 
 
 		 3927 aa  117  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  28.45 
 
 		 7284 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  29.81 
 
 		 1141 aa  103  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  32.29 
 
 		 1206 aa  101  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  25.1 
 
 		 6678 aa  94  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  45.75 
 
 		 4214 aa  93.6  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  53.26 
 
 		 4848 aa  93.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  36.18 
 
 		 5094 aa  93.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  30.32 
 
 		 3026 aa  92  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  28.26 
 
 		 3474 aa  91.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  36.81 
 
 		 2461 aa  89.7  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  31.25 
 
 		 2816 aa  88.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.4 
 
 		 2839 aa  87.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  29.38 
 
 		 3477 aa  85.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  30.62 
 
 		 1728 aa  82.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  24.25 
 
 		 1269 aa  81.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.78 
 
 		 5962 aa  81.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.88 
 
 		 3038 aa  80.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  31.73 
 
 		 2060 aa  80.5  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.42 
 
 		 3816 aa  80.1  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  38.1 
 
 		 6753 aa  80.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  37.84 
 
 		 8682 aa  79.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  33.02 
 
 		 2127 aa  79  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  37.84 
 
 		 9030 aa  78.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  31.94 
 
 		 7233 aa  78.2  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.09 
 
 		 2678 aa  77.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  37.06 
 
 		 5218 aa  77.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  23.72 
 
 		 2767 aa  77  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.37 
 
 		 2507 aa  76.3  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  33.22 
 
 		 1806 aa  73.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  33.22 
 
 		 1350 aa  73.2  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.53 
 
 		 1963 aa  73.2  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  47.92 
 
 		 5171 aa  71.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  31.47 
 
 		 1867 aa  72  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  25.54 
 
 		 2337 aa  71.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  25.81 
 
 		 6211 aa  70.1  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  38.67 
 
 		 3184 aa  69.7  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  25.63 
 
 		 1268 aa  68.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1109 aa  68.6  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  28.63 
 
 		 892 aa  67.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  36.26 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  29.08 
 
 		 7919 aa  66.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  27.38 
 
 		 3699 aa  65.9  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  30.41 
 
 		 3598 aa  65.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.14 
 
 		 2114 aa  65.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.08 
 
 		 3699 aa  64.7  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  29.38 
 
 		 4748 aa  64.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  26.9 
 
 		 3132 aa  63.9  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>