167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003407 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  100 
 
 		 2042 aa  3905    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  61.37 
 
 		 2127 aa  1109    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  34.98 
 
 		 2542 aa  426  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.4 
 
 		 5098 aa  283  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.13 
 
 		 3396 aa  209  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  33.63 
 
 		 2251 aa  174  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  31.86 
 
 		 4848 aa  147  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.61 
 
 		 1661 aa  135  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.44 
 
 		 1340 aa  132  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.25 
 
 		 2194 aa  125  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  40.45 
 
 		 5171 aa  124  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.43 
 
 		 1225 aa  111  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.74 
 
 		 1222 aa  104  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  42.64 
 
 		 814 aa  102  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.18 
 
 		 1118 aa  96.3  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.7 
 
 		 1029 aa  94.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  25.45 
 
 		 1029 aa  89.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.55 
 
 		 1113 aa  89.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.29 
 
 		 8871 aa  89.4  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  23.68 
 
 		 8682 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  38.57 
 
 		 2743 aa  84  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  40.85 
 
 		 5123 aa  83.2  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.67 
 
 		 1800 aa  81.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  27.49 
 
 		 4013 aa  80.5  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  38.73 
 
 		 6211 aa  79.3  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  50 
 
 		 2890 aa  78.6  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.36 
 
 		 1012 aa  75.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  28.88 
 
 		 4214 aa  75.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  23.97 
 
 		 6753 aa  72.4  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  23.76 
 
 		 9030 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  34.25 
 
 		 4285 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.76 
 
 		 889 aa  69.7  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.46 
 
 		 5787 aa  68.9  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  35.48 
 
 		 3263 aa  68.6  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  43.75 
 
 		 5218 aa  67.4  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  38.26 
 
 		 8321 aa  65.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  27.55 
 
 		 16311 aa  65.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.04 
 
 		 5962 aa  65.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.52 
 
 		 2812 aa  64.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  50.77 
 
 		 2239 aa  63.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.05 
 
 		 1269 aa  63.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  35.59 
 
 		 1883 aa  63.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  52.7 
 
 		 1424 aa  63.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  37.31 
 
 		 417 aa  63.2  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  50.77 
 
 		 6779 aa  62.8  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.37 
 
 		 1269 aa  62.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  50.77 
 
 		 6683 aa  62.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  50.77 
 
 		 6662 aa  62.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  36.84 
 
 		 4106 aa  62.4  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  40.23 
 
 		 4678 aa  62.4  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  44.3 
 
 		 2524 aa  62  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.75 
 
 		 1009 aa  61.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  46.48 
 
 		 1166 aa  60.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  38.35 
 
 		 5444 aa  60.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  26.33 
 
 		 5899 aa  59.7  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  30.65 
 
 		 1037 aa  59.7  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  39.76 
 
 		 2125 aa  58.9  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  44.87 
 
 		 542 aa  58.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1806 aa  58.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  53.57 
 
 		 523 aa  57.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.243046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.72 
 
 		 1415 aa  57.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  24.71 
 
 		 2537 aa  57.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.55 
 
 		 4836 aa  57.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  37.76 
 
 		 3184 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  48.15 
 
 		 1434 aa  56.2  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  34.15 
 
 		 535 aa  55.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  35.61 
 
 		 535 aa  55.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  48.05 
 
 		 260 aa  55.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  45.9 
 
 		 3314 aa  54.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  29.81 
 
 		 2704 aa  54.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.28 
 
 		 4220 aa  54.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  43.06 
 
 		 768 aa  53.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  38.2 
 
 		 2768 aa  53.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  31.86 
 
 		 3209 aa  53.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  31.2 
 
 		 686 aa  54.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  46.55 
 
 		 4854 aa  53.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  45.16 
 
 		 917 aa  53.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  45.16 
 
 		 681 aa  53.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  40.24 
 
 		 1502 aa  53.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  41.67 
 
 		 525 aa  53.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.79 
 
 		 5839 aa  52.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  44.12 
 
 		 2701 aa  53.1  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  42.35 
 
 		 7679 aa  52.8  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  42.42 
 
 		 817 aa  52.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 2885 aa  52.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  42.65 
 
 		 474 aa  52.8  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  42.35 
 
 		 7919 aa  52.8  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  49.09 
 
 		 709 aa  52.8  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  45.9 
 
 		 4798 aa  52.4  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  42.42 
 
 		 786 aa  52.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.61 
 
 		 1073 aa  51.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  42.11 
 
 		 2198 aa  52  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  49.38 
 
 		 2887 aa  51.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  38.36 
 
 		 1394 aa  51.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.45 
 
 		 1236 aa  51.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  32.06 
 
 		 2305 aa  51.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  25.61 
 
 		 2310 aa  50.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  35.16 
 
 		 1839 aa  51.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  47.17 
 
 		 7149 aa  50.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  32.52 
 
 		 2245 aa  51.6  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>