175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0304 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  100 
 
 		 1806 aa  3420    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  99.12 
 
 		 1350 aa  1370    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  38 
 
 		 2524 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  38.64 
 
 		 2887 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2514  hypothetical protein  39.12 
 
 		 1338 aa  213  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.482262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  65.09 
 
 		 1166 aa  193  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  28.19 
 
 		 3182 aa  181  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  29.8 
 
 		 3714 aa  164  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  32.88 
 
 		 16311 aa  151  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  27.98 
 
 		 3508 aa  145  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  26.99 
 
 		 2784 aa  143  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  27.04 
 
 		 4978 aa  142  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.19 
 
 		 1884 aa  138  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.8 
 
 		 5745 aa  135  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  29.8 
 
 		 1597 aa  134  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  28.13 
 
 		 5123 aa  126  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  27.14 
 
 		 6211 aa  125  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  25.5 
 
 		 4661 aa  124  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  28.24 
 
 		 3229 aa  122  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  28.27 
 
 		 4748 aa  120  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.26 
 
 		 1599 aa  119  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  29.53 
 
 		 1706 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  29.28 
 
 		 1269 aa  115  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.73 
 
 		 4122 aa  112  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  25.78 
 
 		 5020 aa  107  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.31 
 
 		 1553 aa  107  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  27.81 
 
 		 1269 aa  107  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  27.59 
 
 		 1268 aa  105  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  28.78 
 
 		 16322 aa  105  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.45 
 
 		 2067 aa  101  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  29.49 
 
 		 1883 aa  100  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.95 
 
 		 4836 aa  99.8  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  40.94 
 
 		 4854 aa  98.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  28.54 
 
 		 3927 aa  98.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  26.47 
 
 		 3191 aa  98.6  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.15 
 
 		 3038 aa  96.3  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  27 
 
 		 3263 aa  90.5  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  25.87 
 
 		 3259 aa  89.4  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.72 
 
 		 4220 aa  88.6  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.09 
 
 		 3396 aa  86.3  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  35.71 
 
 		 2768 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.61 
 
 		 2239 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  25.58 
 
 		 4285 aa  82  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  31.13 
 
 		 2251 aa  80.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  27.86 
 
 		 2555 aa  80.1  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  44.53 
 
 		 2305 aa  78.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  28.79 
 
 		 3439 aa  77.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  40.14 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  26.93 
 
 		 1141 aa  76.3  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  38.32 
 
 		 2537 aa  73.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  40.5 
 
 		 1699 aa  73.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  43.51 
 
 		 2310 aa  73.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  31.56 
 
 		 4791 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1512 aa  71.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1311  hypothetical protein  39.01 
 
 		 618 aa  70.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0843987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.64 
 
 		 1800 aa  70.1  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  40.29 
 
 		 686 aa  69.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  27.18 
 
 		 7233 aa  67.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  28.15 
 
 		 1728 aa  67.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.45 
 
 		 1433 aa  67  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  30.35 
 
 		 5442 aa  66.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  30.57 
 
 		 2060 aa  65.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.61 
 
 		 3816 aa  65.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  28.65 
 
 		 2337 aa  64.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  39.81 
 
 		 5444 aa  63.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  28.74 
 
 		 3477 aa  63.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  22.21 
 
 		 2767 aa  63.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.8 
 
 		 1661 aa  63.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  47.62 
 
 		 3314 aa  62.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.41 
 
 		 2812 aa  62.8  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  30.89 
 
 		 6006 aa  62.4  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  36.96 
 
 		 1053 aa  62  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  33.33 
 
 		 1037 aa  61.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  26.27 
 
 		 3474 aa  61.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.62 
 
 		 1113 aa  62  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.07 
 
 		 994 aa  61.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 		 3184 aa  61.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.34 
 
 		 2678 aa  60.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  39.81 
 
 		 2542 aa  60.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  39.22 
 
 		 8682 aa  60.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  43.9 
 
 		 5218 aa  60.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  39.22 
 
 		 9030 aa  60.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  33.9 
 
 		 2336 aa  59.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  42.17 
 
 		 4678 aa  59.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  40 
 
 		 3026 aa  59.3  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  30 
 
 		 761 aa  59.3  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.41 
 
 		 5839 aa  59.3  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  47.13 
 
 		 7149 aa  59.3  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  25.73 
 
 		 7284 aa  58.9  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  39.84 
 
 		 6678 aa  58.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  34.33 
 
 		 2042 aa  58.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.27 
 
 		 5962 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  38.26 
 
 		 1428 aa  57.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.54 
 
 		 2812 aa  57.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.76 
 
 		 850 aa  57  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  28.5 
 
 		 814 aa  57.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2286  outer membrane adhesin like proteiin  29.08 
 
 		 510 aa  56.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  40.58 
 
 		 1598 aa  56.6  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  27.55 
 
 		 1215 aa  56.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0015  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1073 aa  56.6  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>