189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5094 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 4013 aa  7618    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  27.44 
 
 		 2022 aa  228  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  44.93 
 
 		 850 aa  215  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.55 
 
 		 962 aa  208  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.4 
 
 		 3396 aa  206  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.46 
 
 		 1158 aa  195  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.03 
 
 		 2194 aa  190  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  39.53 
 
 		 987 aa  187  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.11 
 
 		 674 aa  186  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.16 
 
 		 915 aa  180  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.31 
 
 		 1661 aa  179  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.15 
 
 		 815 aa  179  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  41.5 
 
 		 1441 aa  176  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.54 
 
 		 581 aa  169  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.08 
 
 		 578 aa  163  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  37.85 
 
 		 752 aa  160  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  36.05 
 
 		 588 aa  157  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  34.48 
 
 		 1581 aa  154  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.9 
 
 		 1340 aa  148  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  25.39 
 
 		 5899 aa  144  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.08 
 
 		 1564 aa  140  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  30.73 
 
 		 599 aa  140  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.27 
 
 		 1225 aa  140  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26 
 
 		 1029 aa  140  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.62 
 
 		 1222 aa  139  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  39.53 
 
 		 1028 aa  139  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  25.82 
 
 		 1029 aa  138  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.91 
 
 		 1362 aa  128  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.03 
 
 		 1800 aa  127  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  50.39 
 
 		 433 aa  120  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.7 
 
 		 1118 aa  118  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  48.82 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  32.41 
 
 		 1483 aa  113  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  24.92 
 
 		 2042 aa  110  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 		 1184 aa  108  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  46.4 
 
 		 637 aa  108  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.04 
 
 		 755 aa  108  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.02 
 
 		 1113 aa  107  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 639 aa  106  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.8 
 
 		 1007 aa  106  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  30 
 
 		 4848 aa  104  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  53.47 
 
 		 999 aa  102  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.38 
 
 		 756 aa  103  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  47.5 
 
 		 392 aa  102  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.54 
 
 		 819 aa  99.8  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  40.15 
 
 		 1059 aa  99.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  40 
 
 		 1070 aa  99  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  42.86 
 
 		 558 aa  99  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  33.94 
 
 		 315 aa  98.6  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45 
 
 		 953 aa  99  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.1 
 
 		 1321 aa  98.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  35.88 
 
 		 1338 aa  97.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.31 
 
 		 722 aa  96.7  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  42.19 
 
 		 801 aa  96.7  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  34.48 
 
 		 1037 aa  95.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.57 
 
 		 929 aa  95.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3737 aa  95.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.7 
 
 		 940 aa  94.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0736  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.97 
 
 		 1021 aa  94.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  42.74 
 
 		 1103 aa  92  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  38.13 
 
 		 571 aa  92.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  49.52 
 
 		 452 aa  90.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.9 
 
 		 984 aa  90.5  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  38.35 
 
 		 879 aa  88.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  27.51 
 
 		 3602 aa  88.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  36.69 
 
 		 732 aa  87.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.42 
 
 		 1012 aa  87.4  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.4 
 
 		 1269 aa  87  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.45 
 
 		 695 aa  86.7  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.96 
 
 		 889 aa  86.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.59 
 
 		 1117 aa  85.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  43.55 
 
 		 578 aa  84.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  48.08 
 
 		 1059 aa  84.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  40.78 
 
 		 3793 aa  83.6  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  30.42 
 
 		 1598 aa  83.2  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.22 
 
 		 1269 aa  83.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  24.7 
 
 		 2542 aa  82.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.61 
 
 		 1415 aa  81.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  33.53 
 
 		 1222 aa  80.5  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.06 
 
 		 971 aa  79.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.79 
 
 		 1009 aa  78.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  29.22 
 
 		 2005 aa  76.6  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.53 
 
 		 729 aa  76.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  33.48 
 
 		 2305 aa  75.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  39.42 
 
 		 1332 aa  73.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  33.09 
 
 		 2117 aa  72.8  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.74 
 
 		 1139 aa  72.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  29.82 
 
 		 3920 aa  71.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.77 
 
 		 1060 aa  70.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  32.89 
 
 		 2310 aa  70.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  27.98 
 
 		 2487 aa  70.5  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  26.53 
 
 		 3927 aa  70.1  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  32 
 
 		 722 aa  69.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  26.38 
 
 		 3191 aa  69.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.84 
 
 		 928 aa  68.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1139 aa  68.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 4896 aa  68.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  25.44 
 
 		 2127 aa  68.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.51 
 
 		 1180 aa  67  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.7 
 
 		 1448 aa  66.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>