298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0107 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 4896 aa  9453    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  30.05 
 
 		 3471 aa  516  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  36.03 
 
 		 8918 aa  469  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  33.48 
 
 		 2078 aa  380  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  33.46 
 
 		 3634 aa  374  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  31.91 
 
 		 1989 aa  320  5e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  46.51 
 
 		 3927 aa  314  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  26.21 
 
 		 3602 aa  294  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  30.42 
 
 		 2912 aa  293  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  64.1 
 
 		 2377 aa  268  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  31.14 
 
 		 3486 aa  259  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  38.28 
 
 		 3793 aa  254  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  33 
 
 		 1332 aa  228  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  37.47 
 
 		 900 aa  217  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  30.09 
 
 		 3920 aa  190  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  24.45 
 
 		 4897 aa  176  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  37.43 
 
 		 4978 aa  172  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1059 aa  158  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  23.92 
 
 		 2358 aa  156  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  23.87 
 
 		 2358 aa  154  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  23.54 
 
 		 2490 aa  151  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  27.69 
 
 		 1293 aa  150  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  26.31 
 
 		 2573 aa  146  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  38.01 
 
 		 707 aa  140  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  24 
 
 		 2487 aa  137  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  40.49 
 
 		 1976 aa  129  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  60.47 
 
 		 315 aa  125  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  39.66 
 
 		 2421 aa  122  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  34.97 
 
 		 2807 aa  122  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1227 aa  121  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  24.12 
 
 		 2490 aa  119  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  24.31 
 
 		 2490 aa  118  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  36.79 
 
 		 2478 aa  115  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  23.93 
 
 		 2520 aa  113  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  25.94 
 
 		 2490 aa  111  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  26.19 
 
 		 983 aa  108  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  32.97 
 
 		 976 aa  108  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  38.86 
 
 		 2267 aa  108  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  29.88 
 
 		 3921 aa  106  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  53.57 
 
 		 3191 aa  105  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  29.6 
 
 		 1118 aa  102  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  27.27 
 
 		 3209 aa  100  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  23.51 
 
 		 2485 aa  100  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  24.79 
 
 		 2490 aa  100  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1543 aa  99.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1543 aa  99.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1543 aa  98.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  23.36 
 
 		 2490 aa  98.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  34.6 
 
 		 2642 aa  97.1  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  30.31 
 
 		 1532 aa  97.1  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  24.94 
 
 		 2121 aa  95.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1202 aa  95.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  31.56 
 
 		 1257 aa  95.5  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1252 aa  95.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  35.63 
 
 		 2602 aa  95.1  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  43.68 
 
 		 1483 aa  94.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1537 aa  94.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1541 aa  94.4  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  39.86 
 
 		 2487 aa  93.6  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  40.38 
 
 		 2927 aa  92.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  39.39 
 
 		 2367 aa  91.3  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  39.39 
 
 		 2411 aa  90.9  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  35.84 
 
 		 2278 aa  90.1  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  43.48 
 
 		 3227 aa  89.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  43.02 
 
 		 599 aa  89  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1809 aa  89  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1553 aa  89.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  43.48 
 
 		 1059 aa  89.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  38.93 
 
 		 2454 aa  87.4  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  43.01 
 
 		 1371 aa  86.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  41.94 
 
 		 581 aa  86.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  42.11 
 
 		 2772 aa  86.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  23.12 
 
 		 1857 aa  86.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  29.01 
 
 		 1255 aa  85.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  39 
 
 		 2296 aa  84.3  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  42 
 
 		 1526 aa  84  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  41.61 
 
 		 4071 aa  82.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  29.08 
 
 		 744 aa  82.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  27.25 
 
 		 1258 aa  81.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  27.11 
 
 		 1261 aa  82  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  42.53 
 
 		 2402 aa  80.5  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  25.53 
 
 		 1168 aa  80.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  45.05 
 
 		 751 aa  79.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  27.28 
 
 		 2113 aa  79.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  23.05 
 
 		 5017 aa  79.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0401  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1213 aa  79  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.051931  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  40.22 
 
 		 1067 aa  78.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  21.17 
 
 		 3771 aa  78.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  29.1 
 
 		 1248 aa  78.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  43.96 
 
 		 822 aa  77.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  42.45 
 
 		 1259 aa  78.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  23.89 
 
 		 5010 aa  77.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1547 aa  77.8  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  22.96 
 
 		 2489 aa  77.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1202 aa  77.4  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  40.62 
 
 		 5745 aa  77.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  36.08 
 
 		 2005 aa  76.3  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  23.39 
 
 		 2520 aa  75.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  38.71 
 
 		 2064 aa  75.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  34.07 
 
 		 2270 aa  74.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>