117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0939 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  100 
 
 		 1976 aa  3872    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  51.6 
 
 		 2421 aa  934    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  37.33 
 
 		 2807 aa  486  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  34.87 
 
 		 2454 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1969 aa  334  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  38.69 
 
 		 976 aa  332  6e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  31.92 
 
 		 2411 aa  295  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  31.95 
 
 		 2367 aa  293  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  34.07 
 
 		 2418 aa  266  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  34.17 
 
 		 4978 aa  248  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  28.12 
 
 		 2772 aa  246  3.9999999999999997e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  32.85 
 
 		 1079 aa  228  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.4 
 
 		 3793 aa  191  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  30.47 
 
 		 953 aa  188  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1259 aa  162  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  39.64 
 
 		 4896 aa  141  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  29.18 
 
 		 1987 aa  128  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  34.95 
 
 		 673 aa  116  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  26.86 
 
 		 1527 aa  112  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  24.67 
 
 		 2270 aa  108  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  30.54 
 
 		 1436 aa  103  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  28.83 
 
 		 1657 aa  99  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  25.71 
 
 		 4120 aa  98.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.13 
 
 		 1607 aa  97.1  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  25.84 
 
 		 4429 aa  96.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  33.1 
 
 		 2262 aa  95.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  24.4 
 
 		 940 aa  92.4  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  30.85 
 
 		 1288 aa  91.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1059 aa  87.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.57 
 
 		 1507 aa  87.4  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  22.76 
 
 		 501 aa  84.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  28.1 
 
 		 3542 aa  83.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  29.68 
 
 		 1108 aa  83.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  30.62 
 
 		 808 aa  83.2  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1329 aa  82  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  32.87 
 
 		 430 aa  81.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1243 aa  80.1  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  29.55 
 
 		 3563 aa  80.1  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.09 
 
 		 1848 aa  79  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  28.12 
 
 		 696 aa  78.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  29.94 
 
 		 904 aa  77  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  36.9 
 
 		 707 aa  77  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  26.28 
 
 		 688 aa  72.4  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  27 
 
 		 2416 aa  72  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  44.21 
 
 		 1550 aa  71.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  34.84 
 
 		 1740 aa  72  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  25.72 
 
 		 3834 aa  69.3  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  26.28 
 
 		 3682 aa  69.3  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  27.06 
 
 		 472 aa  68.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  26.09 
 
 		 1748 aa  68.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  46.51 
 
 		 1132 aa  66.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  46.34 
 
 		 14944 aa  65.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  36.7 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  33.73 
 
 		 4071 aa  65.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  31.36 
 
 		 2833 aa  63.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.8 
 
 		 1130 aa  62.4  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  31 
 
 		 603 aa  61.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  49.48 
 
 		 1223 aa  60.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  27.3 
 
 		 1750 aa  59.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  23.49 
 
 		 1345 aa  59.7  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  27.27 
 
 		 1247 aa  59.7  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  30.55 
 
 		 750 aa  59.3  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  30.74 
 
 		 818 aa  58.9  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  22.34 
 
 		 925 aa  58.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  37.6 
 
 		 1295 aa  57.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  25.17 
 
 		 938 aa  57.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  27.42 
 
 		 761 aa  58.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.81 
 
 		 714 aa  56.2  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  25.61 
 
 		 2024 aa  55.8  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.53 
 
 		 1862 aa  55.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  26.33 
 
 		 910 aa  55.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0645  gp16  46.25 
 
 		 246 aa  55.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140847 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  28 
 
 		 917 aa  54.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.57 
 
 		 1383 aa  54.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  44 
 
 		 2207 aa  53.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  35.07 
 
 		 891 aa  53.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  25.53 
 
 		 3295 aa  53.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  41.18 
 
 		 972 aa  52.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  27.89 
 
 		 979 aa  52.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  44.12 
 
 		 721 aa  51.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  39.74 
 
 		 441 aa  51.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  24.1 
 
 		 2278 aa  50.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  27.94 
 
 		 3507 aa  50.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  29.62 
 
 		 1002 aa  50.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  34.48 
 
 		 775 aa  50.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  30.29 
 
 		 1585 aa  50.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  29.14 
 
 		 2487 aa  50.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  23.3 
 
 		 496 aa  49.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.16 
 
 		 540 aa  49.7  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  22.01 
 
 		 1100 aa  49.7  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.44 
 
 		 887 aa  49.3  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  27.27 
 
 		 989 aa  49.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.61 
 
 		 1176 aa  49.3  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  36.7 
 
 		 1531 aa  48.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  32.25 
 
 		 1414 aa  48.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1067 aa  48.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  29.73 
 
 		 513 aa  48.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0803  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1114 aa  48.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  33.09 
 
 		 483 aa  48.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  24.77 
 
 		 1371 aa  48.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>