60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04803 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  880    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1722  hypothetical protein  45.05 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1475  hypothetical protein  26.79 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  56.47 
 
 		 14944 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2694  putative secreted protein  30.17 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2518  hypothetical protein  28.46 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2331  hypothetical protein  29.66 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000192128  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  41.75 
 
 		 972 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3701  hypothetical protein  25.21 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  53.01 
 
 		 1550 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3320  hypothetical protein  27.58 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3917  hypothetical protein  26.16 
 
 		 704 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197264  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  40.95 
 
 		 1969 aa  73.6  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4287  hypothetical protein  22.55 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2691  hypothetical protein  24.08 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  38.78 
 
 		 1132 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.38 
 
 		 1362 aa  69.7  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.98 
 
 		 1607 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  44.12 
 
 		 1657 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0452  hypothetical protein  23.69 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5988  hypothetical protein  23.6 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  36.62 
 
 		 3563 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2146  hypothetical protein  22.71 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0197375  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1456  hypothetical protein  25.09 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.57 
 
 		 1176 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10530  conserved hypothetical protein  24.85 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  37.82 
 
 		 1507 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  44.44 
 
 		 2003 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0197  hypothetical protein  23 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818961  normal  0.0579961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2298  hypothetical protein  22.45 
 
 		 315 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.38 
 
 		 1292 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.12 
 
 		 887 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  40.48 
 
 		 1976 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  37.21 
 
 		 1130 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.08 
 
 		 714 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1423  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.82 
 
 		 139 aa  53.5  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00960  conserved hypothetical protein  23.47 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  36.47 
 
 		 540 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  34.65 
 
 		 1216 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.95 
 
 		 1221 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35 
 
 		 805 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6291  hypothetical protein  41.56 
 
 		 344 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  43.16 
 
 		 994 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  33.61 
 
 		 775 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.79 
 
 		 810 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  34.52 
 
 		 826 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.86 
 
 		 1383 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  34.94 
 
 		 1195 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  37.04 
 
 		 1170 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08190  conserved hypothetical protein  21.85 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1083  immunoglobulin I-set domain protein  36.71 
 
 		 134 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.78 
 
 		 633 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.67 
 
 		 1183 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  34.88 
 
 		 1126 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2886  major tail protein  34.18 
 
 		 238 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146277 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2176  major tail protein  34.18 
 
 		 238 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430295 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0645  gp16  37.84 
 
 		 246 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  32.08 
 
 		 1026 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  34.26 
 
 		 910 aa  43.5  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.28 
 
 		 1343 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>