33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0373 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  958    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  36.29 
 
 		 904 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  38.36 
 
 		 808 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  35.94 
 
 		 910 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  35.47 
 
 		 818 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2615  CHAP domain-containing protein  31.09 
 
 		 560 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4059  hypothetical protein  28.09 
 
 		 587 aa  97.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  28.8 
 
 		 2024 aa  91.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  29.55 
 
 		 3834 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  36 
 
 		 637 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1638  hypothetical protein  36.21 
 
 		 861 aa  71.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3335  hypothetical protein  34.34 
 
 		 577 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304879  normal  0.237472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4852  hypothetical protein  30.66 
 
 		 316 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  27.44 
 
 		 2713 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  25.33 
 
 		 1750 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.84 
 
 		 1507 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2076  hypothetical protein  28.67 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.43 
 
 		 1607 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0442  hypothetical protein  29.2 
 
 		 237 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4263  hypothetical protein  39.66 
 
 		 848 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  29.25 
 
 		 1288 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0364  fibro-slime family protein  36.47 
 
 		 570 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.227511 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6193  outer capsid protein Hoc  41.43 
 
 		 228 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  30.33 
 
 		 2345 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  26.15 
 
 		 1554 aa  47  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  24.18 
 
 		 1657 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.71 
 
 		 747 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.55 
 
 		 591 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  34.48 
 
 		 14944 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1329 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.83 
 
 		 1343 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1059 aa  43.9  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1289 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>