53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4057 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  100 
 
 		 910 aa  1785    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4059  hypothetical protein  36.12 
 
 		 587 aa  336  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360369  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  35.77 
 
 		 904 aa  194  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  36.7 
 
 		 808 aa  177  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  35.94 
 
 		 496 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  35.04 
 
 		 818 aa  142  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3335  hypothetical protein  45.51 
 
 		 577 aa  118  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304879  normal  0.237472 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  29.3 
 
 		 2024 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  30.3 
 
 		 3834 aa  111  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2615  CHAP domain-containing protein  33.58 
 
 		 560 aa  106  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  40.21 
 
 		 637 aa  105  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4852  hypothetical protein  39.79 
 
 		 316 aa  103  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  29.65 
 
 		 2713 aa  91.7  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.44 
 
 		 1607 aa  85.5  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  31.57 
 
 		 1288 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  28.82 
 
 		 4120 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  31.48 
 
 		 2318 aa  77  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  28.32 
 
 		 2345 aa  72.8  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4263  hypothetical protein  53.73 
 
 		 848 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  30.65 
 
 		 3793 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  28.71 
 
 		 1554 aa  68.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6193  outer capsid protein Hoc  47 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1638  hypothetical protein  35.33 
 
 		 861 aa  65.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.91 
 
 		 1507 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  37.28 
 
 		 14944 aa  64.7  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1969 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.07 
 
 		 747 aa  62  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  36.22 
 
 		 1295 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0364  fibro-slime family protein  46.75 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.227511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.83 
 
 		 1657 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  27.71 
 
 		 2182 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09720  hypothetical protein  28.24 
 
 		 704 aa  57  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.506636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1824  hypothetical protein  37.84 
 
 		 460 aa  56.2  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  29.5 
 
 		 1108 aa  55.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  25.49 
 
 		 1750 aa  54.7  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2076  hypothetical protein  28.86 
 
 		 465 aa  54.3  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  23.31 
 
 		 668 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  35.29 
 
 		 3563 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  28.64 
 
 		 1550 aa  52.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  37.11 
 
 		 1289 aa  50.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  25.3 
 
 		 1079 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  32 
 
 		 1126 aa  48.1  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  23.12 
 
 		 752 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.4 
 
 		 1176 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.97 
 
 		 6885 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.64 
 
 		 648 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  27.86 
 
 		 822 aa  45.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  27.03 
 
 		 2418 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  24.22 
 
 		 3619 aa  45.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  38.1 
 
 		 655 aa  45.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  28.12 
 
 		 676 aa  44.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  22.79 
 
 		 346 aa  44.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  29.91 
 
 		 799 aa  44.3  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>