68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4127 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  100 
 
 		 2318 aa  4691    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  30.74 
 
 		 3273 aa  102  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  31.48 
 
 		 910 aa  77.4  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1164 aa  77.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  30.87 
 
 		 2215 aa  73.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  26.84 
 
 		 1046 aa  69.3  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  22.91 
 
 		 2225 aa  68.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  23.15 
 
 		 2221 aa  68.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  22.98 
 
 		 2178 aa  66.6  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  22.78 
 
 		 2246 aa  65.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  22.14 
 
 		 2224 aa  63.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  22.14 
 
 		 2224 aa  63.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  22.14 
 
 		 2224 aa  62.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  30.18 
 
 		 808 aa  62.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  25.28 
 
 		 1710 aa  61.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1917 aa  59.7  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  30.14 
 
 		 2447 aa  58.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  21.39 
 
 		 1959 aa  58.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1101 aa  57.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1824  hypothetical protein  32.43 
 
 		 460 aa  56.6  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  27.37 
 
 		 1586 aa  57  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  37.78 
 
 		 2831 aa  56.6  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  28.19 
 
 		 2096 aa  56.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1840 aa  56.2  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  29.02 
 
 		 3027 aa  55.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  26.45 
 
 		 2349 aa  55.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.95 
 
 		 1576 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1669 aa  55.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1931 aa  55.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  27.5 
 
 		 2658 aa  55.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  29.96 
 
 		 904 aa  54.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1942 aa  54.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  30.1 
 
 		 1600 aa  54.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  36.67 
 
 		 2961 aa  54.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  34.44 
 
 		 1362 aa  54.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  28.43 
 
 		 2113 aa  53.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.63 
 
 		 430 aa  53.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  37.8 
 
 		 1352 aa  52.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  34.16 
 
 		 931 aa  52.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  33.63 
 
 		 837 aa  52.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  35.14 
 
 		 1604 aa  52  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  32.62 
 
 		 2294 aa  50.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  33.33 
 
 		 1475 aa  50.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.91 
 
 		 1599 aa  50.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  33.9 
 
 		 1583 aa  50.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  30.29 
 
 		 2149 aa  48.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  30.28 
 
 		 1447 aa  49.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  26.95 
 
 		 1368 aa  48.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1558 aa  48.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1611 aa  48.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1565 aa  48.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  28.07 
 
 		 2035 aa  48.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1565 aa  48.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  33.08 
 
 		 1554 aa  47.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.36 
 
 		 1572 aa  47.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02144  putative RHS-related transmembrane protein  30.92 
 
 		 863 aa  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  29.14 
 
 		 818 aa  48.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  29.78 
 
 		 442 aa  47.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.53 
 
 		 2277 aa  47.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  52.38 
 
 		 1981 aa  47.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  29.07 
 
 		 1437 aa  47  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  34.15 
 
 		 1428 aa  46.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3796  YD repeat-containing protein  33.08 
 
 		 422 aa  46.6  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.982597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  29.73 
 
 		 1422 aa  46.2  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  30.6 
 
 		 1423 aa  46.2  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  30.05 
 
 		 1457 aa  46.2  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  25.3 
 
 		 1400 aa  45.8  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  28.12 
 
 		 1384 aa  45.8  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>