57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0216 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 837 aa  1587    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  29.03 
 
 		 1838 aa  107  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.46 
 
 		 1019 aa  104  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  30.93 
 
 		 1490 aa  91.3  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.93 
 
 		 891 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.83 
 
 		 1340 aa  81.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.82 
 
 		 1225 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.48 
 
 		 1113 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  32.13 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.5 
 
 		 889 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.54 
 
 		 1222 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.06 
 
 		 2194 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.25 
 
 		 2807 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.54 
 
 		 1118 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0957  OmpA/MotB domain protein  42.75 
 
 		 716 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0225193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.61 
 
 		 1009 aa  71.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.27 
 
 		 1126 aa  71.2  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.25 
 
 		 1275 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  24.8 
 
 		 1557 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  42.35 
 
 		 913 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  35.26 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  26.76 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.53 
 
 		 1012 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  33.08 
 
 		 872 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  28.87 
 
 		 828 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  43.84 
 
 		 3227 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1289 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  23.94 
 
 		 4379 aa  58.5  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  34.11 
 
 		 978 aa  57.4  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  44.19 
 
 		 1061 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  32.14 
 
 		 685 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  27.59 
 
 		 604 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  26.34 
 
 		 813 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  42.11 
 
 		 1428 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  25.73 
 
 		 616 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  27.15 
 
 		 472 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  27.86 
 
 		 1762 aa  53.9  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  30.29 
 
 		 485 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  24.12 
 
 		 438 aa  52.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  33.63 
 
 		 2318 aa  52  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 1127 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.54 
 
 		 621 aa  48.9  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  28.27 
 
 		 494 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  23.92 
 
 		 437 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  33.53 
 
 		 469 aa  48.5  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  27.4 
 
 		 1527 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  31.15 
 
 		 657 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0364  fibro-slime family protein  38.89 
 
 		 570 aa  46.6  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.227511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  33.03 
 
 		 644 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  37.33 
 
 		 1424 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2584  hypothetical protein  42.11 
 
 		 793 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.54 
 
 		 615 aa  45.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  28.99 
 
 		 2762 aa  45.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.21 
 
 		 635 aa  44.3  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  28.78 
 
 		 1489 aa  44.3  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  28.78 
 
 		 1496 aa  44.3  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  29.94 
 
 		 1447 aa  44.3  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.504601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>