58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2527 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  100 
 
 		 904 aa  1727    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  51.23 
 
 		 808 aa  399  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  47.87 
 
 		 818 aa  244  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  31.67 
 
 		 3834 aa  195  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  35.77 
 
 		 910 aa  195  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  32.76 
 
 		 2024 aa  177  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  36.16 
 
 		 496 aa  171  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2615  CHAP domain-containing protein  36.16 
 
 		 560 aa  161  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22490  hypothetical protein  47.3 
 
 		 304 aa  132  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.659605  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  40.98 
 
 		 637 aa  115  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3919  protein of unknown function DUF1535  57.14 
 
 		 216 aa  115  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33750  protein of unknown function (DUF1535)  54.74 
 
 		 199 aa  110  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4059  hypothetical protein  32.34 
 
 		 587 aa  108  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3335  hypothetical protein  40.13 
 
 		 577 aa  106  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304879  normal  0.237472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  29 
 
 		 4120 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  30.13 
 
 		 2345 aa  92.8  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09720  hypothetical protein  29.89 
 
 		 704 aa  86.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.506636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  25.42 
 
 		 2713 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1638  hypothetical protein  40.78 
 
 		 861 aa  86.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  34.64 
 
 		 1288 aa  84  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  33.57 
 
 		 585 aa  84  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  28.44 
 
 		 1657 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  33.77 
 
 		 1554 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3380  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00652968  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.5 
 
 		 1607 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.61 
 
 		 1507 aa  68.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1329 aa  67.8  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  27.32 
 
 		 1750 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  26.75 
 
 		 3793 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6193  outer capsid protein Hoc  36.73 
 
 		 228 aa  63.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4852  hypothetical protein  30.97 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17840  protein of unknown function (DUF1535)  30.99 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1969 aa  61.6  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1469  hypothetical protein  39.13 
 
 		 206 aa  59.7  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.22306  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1268  hypothetical protein  40.22 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0364  fibro-slime family protein  34.19 
 
 		 570 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.227511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1976 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  29.96 
 
 		 2318 aa  55.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  27.44 
 
 		 1079 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  35.71 
 
 		 14944 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4263  hypothetical protein  41.94 
 
 		 848 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2076  hypothetical protein  27.64 
 
 		 465 aa  53.5  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  36.52 
 
 		 1126 aa  52.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  24.74 
 
 		 1345 aa  52  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  30.6 
 
 		 3608 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  37.74 
 
 		 1289 aa  51.2  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.21 
 
 		 1343 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0817  hypothetical protein  36.96 
 
 		 198 aa  49.7  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  30.13 
 
 		 3619 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0882  surface lipoprotein-related protein  26.45 
 
 		 227 aa  49.7  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  30.16 
 
 		 822 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  33.33 
 
 		 3619 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.89 
 
 		 591 aa  48.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1146  hypothetical protein  32.26 
 
 		 169 aa  46.6  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000279889  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  30.48 
 
 		 1108 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  27.53 
 
 		 3542 aa  45.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 		 1839 aa  44.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 		 1857 aa  44.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>