15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1146 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1146  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  340  7e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000279889  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0817  hypothetical protein  66.67 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17840  protein of unknown function (DUF1535)  59.14 
 
 		 299 aa  118  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1360  surface lipoprotein-related protein  44.63 
 
 		 221 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.813334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0882  surface lipoprotein-related protein  33.15 
 
 		 227 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1268  hypothetical protein  51.06 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1469  hypothetical protein  48.94 
 
 		 206 aa  97.4  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.22306  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1227  hypothetical protein  47.47 
 
 		 198 aa  86.7  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000082221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3380  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00652968  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3919  protein of unknown function DUF1535  33.33 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  31.63 
 
 		 904 aa  51.6  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33750  protein of unknown function (DUF1535)  32.63 
 
 		 199 aa  47.4  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22490  hypothetical protein  31.87 
 
 		 304 aa  44.3  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.659605  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  33.72 
 
 		 585 aa  43.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2243  hypothetical protein  37.78 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.116823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>