107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0189 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  100 
 
 		 585 aa  1211    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22490  hypothetical protein  45.39 
 
 		 304 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.659605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3380  hypothetical protein  59.38 
 
 		 131 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00652968  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3919  protein of unknown function DUF1535  52.56 
 
 		 216 aa  91.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  33.57 
 
 		 904 aa  84.3  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33750  protein of unknown function (DUF1535)  41.12 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  52.17 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17840  protein of unknown function (DUF1535)  32.19 
 
 		 299 aa  67  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1227  hypothetical protein  27.62 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000082221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  43.66 
 
 		 81 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 80 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 80 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  44.62 
 
 		 81 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  37.35 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4626  HNH endonuclease  53.23 
 
 		 69 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  40 
 
 		 177 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  38.36 
 
 		 163 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  39.71 
 
 		 185 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  37.31 
 
 		 459 aa  51.6  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 111 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  40.62 
 
 		 187 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 116 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  48.08 
 
 		 842 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  40 
 
 		 185 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  44.64 
 
 		 321 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 169 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 459 aa  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 170 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  41.67 
 
 		 168 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  30.09 
 
 		 187 aa  49.3  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 167 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  40 
 
 		 185 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  39.68 
 
 		 167 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 186 aa  49.7  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  36.51 
 
 		 170 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  40 
 
 		 171 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  35.48 
 
 		 116 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  40 
 
 		 166 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0227  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 149 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  35 
 
 		 189 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  40.32 
 
 		 116 aa  48.9  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 177 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 171 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1469  hypothetical protein  35.48 
 
 		 206 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.22306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 101 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  27.59 
 
 		 552 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  39.34 
 
 		 175 aa  47.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  40 
 
 		 170 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  30.7 
 
 		 438 aa  47.8  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  38.1 
 
 		 184 aa  47.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 168 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 165 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  28.57 
 
 		 198 aa  47.4  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 181 aa  47  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  29.89 
 
 		 174 aa  47  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  34.48 
 
 		 133 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  25.98 
 
 		 165 aa  46.6  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 198 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1268  hypothetical protein  36.56 
 
 		 205 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  34.94 
 
 		 186 aa  47  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  29 
 
 		 183 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 165 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 162 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  39.44 
 
 		 206 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 165 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2162  HNH endonuclease  43.06 
 
 		 250 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.097975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  34.25 
 
 		 123 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  33.82 
 
 		 168 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  36.67 
 
 		 174 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  32.35 
 
 		 174 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  29.9 
 
 		 182 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 173 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  33.72 
 
 		 186 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  39.66 
 
 		 169 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  36.23 
 
 		 427 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  41.54 
 
 		 363 aa  45.4  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  29.27 
 
 		 182 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  39.71 
 
 		 230 aa  45.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  29.27 
 
 		 182 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 174 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 213 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  33.82 
 
 		 168 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  26.62 
 
 		 196 aa  45.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  29.27 
 
 		 182 aa  45.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  36.23 
 
 		 172 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 174 aa  44.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 174 aa  45.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  32.26 
 
 		 152 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  35 
 
 		 218 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  36.67 
 
 		 189 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  27.87 
 
 		 139 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 143 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 165 aa  44.3  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  35 
 
 		 168 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  28.43 
 
 		 173 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 386 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  34.52 
 
 		 228 aa  44.3  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 186 aa  43.9  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>