More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2125 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 842 aa  1739    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  26 
 
 		 539 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0594  type III restriction protein res subunit  26.71 
 
 		 525 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  27.45 
 
 		 629 aa  90.5  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  26.33 
 
 		 643 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  24.23 
 
 		 1077 aa  81.3  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  25.13 
 
 		 606 aa  79.7  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  25.56 
 
 		 967 aa  79.7  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  25.12 
 
 		 979 aa  79  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  24.58 
 
 		 773 aa  79  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  26.42 
 
 		 581 aa  79.3  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  23.89 
 
 		 1418 aa  78.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  27.07 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8690  putative helicase  23.75 
 
 		 469 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 607 aa  76.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  22.79 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  23.81 
 
 		 905 aa  75.5  0.000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  22.94 
 
 		 1348 aa  74.7  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  24.53 
 
 		 928 aa  74.7  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  24.36 
 
 		 706 aa  74.7  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  25.94 
 
 		 1287 aa  74.3  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  23.39 
 
 		 848 aa  73.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  24.27 
 
 		 812 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  24.87 
 
 		 956 aa  73.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  23.13 
 
 		 583 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  22.45 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3708  helicase-like  25.36 
 
 		 295 aa  72  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  21.55 
 
 		 815 aa  71.2  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  23.37 
 
 		 580 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  24.14 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  22.73 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  23.93 
 
 		 938 aa  69.3  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  23.08 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  25.2 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  24.08 
 
 		 590 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  22.11 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  24.94 
 
 		 590 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  26.24 
 
 		 953 aa  68.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  26.24 
 
 		 953 aa  68.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  23.52 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  23.9 
 
 		 531 aa  67.4  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  21.77 
 
 		 479 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  24.07 
 
 		 590 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  25.23 
 
 		 993 aa  67.4  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  25 
 
 		 797 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  25.78 
 
 		 560 aa  66.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  22.51 
 
 		 462 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  22.53 
 
 		 585 aa  66.6  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  25.78 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  20.43 
 
 		 613 aa  65.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.23 
 
 		 974 aa  65.1  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  25.5 
 
 		 979 aa  64.7  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  21.81 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  25.82 
 
 		 560 aa  64.7  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  25.39 
 
 		 760 aa  64.3  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  25.39 
 
 		 760 aa  64.7  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  21.59 
 
 		 583 aa  64.3  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  22.3 
 
 		 584 aa  64.3  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  23.46 
 
 		 987 aa  63.9  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  22.22 
 
 		 602 aa  63.9  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  21.78 
 
 		 585 aa  63.9  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  25.41 
 
 		 560 aa  63.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  26.23 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  27.82 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  22.3 
 
 		 584 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  23.77 
 
 		 560 aa  62.4  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  22.6 
 
 		 1847 aa  62  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  25.08 
 
 		 550 aa  62  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  23.04 
 
 		 586 aa  62  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  23.04 
 
 		 586 aa  62  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  26.23 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2747  type I restriction-modification system, R subunit  25.51 
 
 		 934 aa  61.6  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.504328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  22.07 
 
 		 584 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  23.02 
 
 		 1149 aa  61.2  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  23 
 
 		 585 aa  61.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  23 
 
 		 585 aa  61.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  23.15 
 
 		 1053 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  23.1 
 
 		 569 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  23.62 
 
 		 459 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  22.65 
 
 		 585 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  21.72 
 
 		 591 aa  60.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  25.77 
 
 		 776 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  21.15 
 
 		 524 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  22.69 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  23.39 
 
 		 586 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  21.63 
 
 		 813 aa  60.1  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  23.21 
 
 		 579 aa  60.1  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  22.65 
 
 		 586 aa  60.1  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  22.27 
 
 		 584 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  24.44 
 
 		 545 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  22.69 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  22.69 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  21.78 
 
 		 946 aa  59.3  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  22.1 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  22.69 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11338  hypothetical protein  24.69 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  22.69 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  22.62 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  24.26 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  23.23 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>