More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11338 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11338  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  1042    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  63.95 
 
 		 512 aa  664    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  49.49 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  31.39 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  28.69 
 
 		 462 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  30.8 
 
 		 629 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.97 
 
 		 504 aa  139  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  30.03 
 
 		 475 aa  137  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  27.61 
 
 		 581 aa  133  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  29.12 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  29.86 
 
 		 607 aa  124  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  28.3 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  27.38 
 
 		 560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  26.51 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  28.8 
 
 		 580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  26.35 
 
 		 773 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  27.49 
 
 		 580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  26.76 
 
 		 560 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  27.09 
 
 		 560 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  26.49 
 
 		 560 aa  113  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  26.24 
 
 		 560 aa  113  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  27.49 
 
 		 580 aa  113  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  26.02 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  29.72 
 
 		 812 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  28 
 
 		 536 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  27.51 
 
 		 574 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  26.76 
 
 		 560 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  25.89 
 
 		 643 aa  110  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  26.67 
 
 		 590 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  27.39 
 
 		 583 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  28.53 
 
 		 813 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  27.32 
 
 		 657 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  27.78 
 
 		 569 aa  107  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  26.13 
 
 		 590 aa  106  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  25.95 
 
 		 590 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  26.61 
 
 		 584 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  25.34 
 
 		 584 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  26.22 
 
 		 590 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  27.03 
 
 		 550 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  27.01 
 
 		 579 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  25.41 
 
 		 602 aa  104  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  28 
 
 		 815 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  26.02 
 
 		 584 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  27.13 
 
 		 583 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  26.36 
 
 		 585 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  25.73 
 
 		 584 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  27.76 
 
 		 616 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  26.04 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 967 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  27.68 
 
 		 588 aa  97.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  26.61 
 
 		 545 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  24.74 
 
 		 706 aa  95.9  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  27.27 
 
 		 583 aa  94  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  27.02 
 
 		 1062 aa  93.6  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1302  putative helicase  26.03 
 
 		 516 aa  93.2  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  26.33 
 
 		 545 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  24.39 
 
 		 585 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  25.2 
 
 		 585 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  28.49 
 
 		 905 aa  92  2e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  25.2 
 
 		 585 aa  92  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  25.2 
 
 		 585 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  25.29 
 
 		 586 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  25.57 
 
 		 584 aa  91.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  24.32 
 
 		 502 aa  91.3  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  27.33 
 
 		 1051 aa  90.1  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  23.13 
 
 		 524 aa  90.1  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 586 aa  90.1  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  26.54 
 
 		 586 aa  90.1  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  27.43 
 
 		 1052 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  27.43 
 
 		 1063 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  25.77 
 
 		 545 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  25.45 
 
 		 1287 aa  87.4  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  25.97 
 
 		 1061 aa  87  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  24.13 
 
 		 586 aa  87  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  24.46 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  26.69 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  26.59 
 
 		 1028 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  26.69 
 
 		 586 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  26.69 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  26.69 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  25.15 
 
 		 946 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.77 
 
 		 1031 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  27.49 
 
 		 1149 aa  85.9  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  26.69 
 
 		 586 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  26.79 
 
 		 783 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  26.87 
 
 		 1051 aa  84  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  27.66 
 
 		 1043 aa  83.6  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  25.31 
 
 		 1055 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  23.99 
 
 		 586 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  23.99 
 
 		 586 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  25 
 
 		 982 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  23.99 
 
 		 586 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  23.99 
 
 		 586 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  23.72 
 
 		 586 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  23.16 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  23.99 
 
 		 586 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  23.06 
 
 		 586 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  24.37 
 
 		 761 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  23.06 
 
 		 586 aa  81.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  24.23 
 
 		 1041 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>