More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17070 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  100 
 
 		 1031 aa  2098    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  38.28 
 
 		 1065 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  41.5 
 
 		 1033 aa  663    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  36.94 
 
 		 1055 aa  645    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  41.23 
 
 		 1033 aa  651    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  46.75 
 
 		 1035 aa  844    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  46.63 
 
 		 1051 aa  897    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  47.44 
 
 		 1063 aa  904    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  40.61 
 
 		 1066 aa  644    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  47.91 
 
 		 1029 aa  793    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  37.03 
 
 		 1055 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  36.84 
 
 		 1055 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  51.59 
 
 		 1033 aa  966    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  45.97 
 
 		 1028 aa  843    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  36.04 
 
 		 1052 aa  638    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  38.92 
 
 		 1062 aa  685    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  38.6 
 
 		 982 aa  634  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  36.23 
 
 		 1061 aa  631  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  37.53 
 
 		 1041 aa  626  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  36.66 
 
 		 1043 aa  626  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  36.46 
 
 		 1017 aa  622  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  37.7 
 
 		 1042 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  36.99 
 
 		 1042 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  35.81 
 
 		 1051 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  37.71 
 
 		 1058 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  29.06 
 
 		 993 aa  392  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  35.41 
 
 		 1053 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  32.73 
 
 		 938 aa  346  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  32.68 
 
 		 848 aa  325  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  33.39 
 
 		 905 aa  316  9.999999999999999e-85  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  37.31 
 
 		 1287 aa  291  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  34.96 
 
 		 1077 aa  286  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  30.39 
 
 		 1149 aa  277  7e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  28.99 
 
 		 946 aa  275  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  30.02 
 
 		 813 aa  273  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.34 
 
 		 974 aa  272  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  29.56 
 
 		 812 aa  270  8.999999999999999e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  32.4 
 
 		 967 aa  267  8e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  35.24 
 
 		 928 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  34.48 
 
 		 1418 aa  264  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  30.8 
 
 		 953 aa  262  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  30.8 
 
 		 953 aa  262  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  34.24 
 
 		 956 aa  261  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  33.33 
 
 		 987 aa  259  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  30.68 
 
 		 815 aa  258  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  28.57 
 
 		 952 aa  258  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  29.22 
 
 		 949 aa  257  9e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  33.97 
 
 		 1348 aa  255  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.06 
 
 		 979 aa  252  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  32.64 
 
 		 979 aa  249  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  30.9 
 
 		 980 aa  233  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  29.21 
 
 		 949 aa  231  5e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  33.65 
 
 		 967 aa  229  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  36.06 
 
 		 773 aa  178  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  34.82 
 
 		 475 aa  156  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  33.13 
 
 		 536 aa  151  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  31.16 
 
 		 581 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  31.34 
 
 		 558 aa  137  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  28.85 
 
 		 459 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  32.24 
 
 		 462 aa  131  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  27.4 
 
 		 385 aa  130  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  33.63 
 
 		 469 aa  128  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  31.04 
 
 		 607 aa  120  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  31.99 
 
 		 556 aa  115  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  28.7 
 
 		 643 aa  114  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  30.6 
 
 		 606 aa  114  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  28.93 
 
 		 545 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  29.67 
 
 		 545 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  29.59 
 
 		 550 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  27.14 
 
 		 783 aa  111  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  29 
 
 		 545 aa  111  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  28.16 
 
 		 811 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  27.11 
 
 		 802 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  31.23 
 
 		 524 aa  108  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  27.34 
 
 		 796 aa  106  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  27.1 
 
 		 760 aa  103  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  27.1 
 
 		 760 aa  103  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  30.65 
 
 		 560 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  30.34 
 
 		 560 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  28.7 
 
 		 629 aa  102  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  28.54 
 
 		 804 aa  102  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  29.02 
 
 		 821 aa  100  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  26.97 
 
 		 706 aa  99.4  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  28.22 
 
 		 809 aa  99.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  28.05 
 
 		 810 aa  99.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  25.67 
 
 		 860 aa  99  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  28.83 
 
 		 771 aa  98.6  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  25.81 
 
 		 797 aa  98.6  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  29.32 
 
 		 585 aa  98.6  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  27.98 
 
 		 824 aa  99  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  28.68 
 
 		 829 aa  98.2  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  28.05 
 
 		 825 aa  98.2  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  27.23 
 
 		 776 aa  97.8  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  26.39 
 
 		 538 aa  97.8  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  27.65 
 
 		 765 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  29.05 
 
 		 761 aa  96.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  29.35 
 
 		 569 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.5 
 
 		 657 aa  95.9  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  28.32 
 
 		 800 aa  95.5  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  27.49 
 
 		 574 aa  95.1  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>