More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0337 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  74.52 
 
 		 987 aa  1483    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  100 
 
 		 979 aa  2044    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  47.65 
 
 		 1287 aa  863    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  55.58 
 
 		 967 aa  1090    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  39.63 
 
 		 1077 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  38.15 
 
 		 1418 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  43.21 
 
 		 938 aa  508  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  37.67 
 
 		 1348 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  43.43 
 
 		 956 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  43.1 
 
 		 928 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  37.96 
 
 		 848 aa  456  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  32.12 
 
 		 813 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  33.29 
 
 		 812 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  32.49 
 
 		 815 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  35.4 
 
 		 1053 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  35.11 
 
 		 993 aa  348  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  33.78 
 
 		 1149 aa  339  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  34.28 
 
 		 946 aa  335  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.39 
 
 		 974 aa  334  5e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  31.74 
 
 		 953 aa  301  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  28.69 
 
 		 979 aa  301  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  31.74 
 
 		 953 aa  301  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  38.99 
 
 		 967 aa  296  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  36.36 
 
 		 1028 aa  296  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  33.38 
 
 		 1035 aa  288  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  33.51 
 
 		 952 aa  287  5.999999999999999e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  33.75 
 
 		 1033 aa  283  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  32.68 
 
 		 1033 aa  283  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  33.59 
 
 		 1033 aa  282  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  31.65 
 
 		 949 aa  281  4e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  34.25 
 
 		 1043 aa  280  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  32.62 
 
 		 1029 aa  278  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  33.01 
 
 		 1066 aa  278  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  35.33 
 
 		 1051 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  29.3 
 
 		 949 aa  275  3e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  34.14 
 
 		 1063 aa  274  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  32.23 
 
 		 1062 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  32.86 
 
 		 1052 aa  268  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  33.55 
 
 		 1017 aa  263  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  33.86 
 
 		 1055 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  33.86 
 
 		 1055 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  33.86 
 
 		 1055 aa  262  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  30.6 
 
 		 980 aa  261  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  30.97 
 
 		 1061 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  32.41 
 
 		 1041 aa  261  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  34.33 
 
 		 982 aa  260  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  32.31 
 
 		 1058 aa  260  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  31.74 
 
 		 1051 aa  259  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  31.38 
 
 		 1042 aa  252  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.06 
 
 		 1031 aa  251  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  32.62 
 
 		 1065 aa  251  5e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  31.07 
 
 		 1042 aa  244  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  28.97 
 
 		 905 aa  242  2e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  35.61 
 
 		 773 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  34.02 
 
 		 385 aa  155  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  31.34 
 
 		 524 aa  140  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  31.28 
 
 		 606 aa  140  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  29.97 
 
 		 462 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  30.92 
 
 		 607 aa  136  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  29.79 
 
 		 459 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  29.19 
 
 		 536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  29.43 
 
 		 475 aa  127  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  31.14 
 
 		 706 aa  124  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2220  hypothetical protein  65.12 
 
 		 294 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.562631  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  27.32 
 
 		 643 aa  122  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  28.9 
 
 		 469 aa  118  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  29.01 
 
 		 545 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  28.05 
 
 		 560 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  28.5 
 
 		 558 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  28.73 
 
 		 545 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  28.11 
 
 		 791 aa  115  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  28.45 
 
 		 545 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  28.53 
 
 		 581 aa  110  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  26.75 
 
 		 560 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  27.05 
 
 		 560 aa  109  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  27.57 
 
 		 790 aa  108  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 860 aa  108  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  28.16 
 
 		 629 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  27.36 
 
 		 398 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  27.36 
 
 		 560 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  25.32 
 
 		 796 aa  105  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  27.05 
 
 		 560 aa  105  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  28.01 
 
 		 556 aa  105  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  26.75 
 
 		 560 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  27.2 
 
 		 1141 aa  102  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  26.14 
 
 		 550 aa  101  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3004  type III restriction protein res subunit  25.79 
 
 		 1129 aa  99  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385036  normal  0.0400425 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  26.9 
 
 		 760 aa  97.8  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  24.44 
 
 		 538 aa  97.8  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  26.33 
 
 		 569 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  26.4 
 
 		 760 aa  97.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  26.06 
 
 		 811 aa  96.3  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  25.31 
 
 		 1115 aa  95.5  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  24.93 
 
 		 1108 aa  94.4  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  26.44 
 
 		 583 aa  94  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 1005 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  24.8 
 
 		 1113 aa  93.2  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  25.26 
 
 		 1233 aa  92.8  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  24.69 
 
 		 821 aa  91.3  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  26.04 
 
 		 776 aa  91.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>