More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0909 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  77.17 
 
 
1041 aa  1705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  38.97 
 
 
1055 aa  694    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  39.56 
 
 
1017 aa  667    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  41.74 
 
 
982 aa  693    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  39.94 
 
 
1052 aa  692    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  40.45 
 
 
1066 aa  648    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  39.37 
 
 
1055 aa  696    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  37.94 
 
 
1028 aa  654    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  73.65 
 
 
1042 aa  1630    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  38.33 
 
 
1051 aa  687    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  39.27 
 
 
1055 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  37.59 
 
 
1051 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  37.75 
 
 
1035 aa  648    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  38.22 
 
 
1061 aa  694    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  37.05 
 
 
1063 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  38.88 
 
 
1043 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  100 
 
 
1042 aa  2156    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  40.3 
 
 
1062 aa  756    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  37.08 
 
 
1033 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  37.21 
 
 
1033 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  36.39 
 
 
1065 aa  610  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  37.7 
 
 
1031 aa  610  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  37.16 
 
 
1033 aa  605  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  37.27 
 
 
1029 aa  597  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  34.88 
 
 
1058 aa  524  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  34.21 
 
 
1053 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  32.5 
 
 
993 aa  336  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  31.27 
 
 
905 aa  326  1e-87  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  27.9 
 
 
952 aa  322  3e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  35.94 
 
 
1287 aa  306  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  30.09 
 
 
956 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  29.69 
 
 
946 aa  299  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.36 
 
 
974 aa  296  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  34.17 
 
 
1077 aa  291  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  32.42 
 
 
953 aa  285  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  32.42 
 
 
953 aa  285  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  31.02 
 
 
848 aa  281  5e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  32.97 
 
 
949 aa  278  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  29.58 
 
 
1149 aa  277  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  34.29 
 
 
928 aa  276  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  34.05 
 
 
938 aa  269  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  29.6 
 
 
949 aa  266  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  30.05 
 
 
812 aa  263  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  33.55 
 
 
1418 aa  260  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  29.27 
 
 
815 aa  258  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  33.61 
 
 
1348 aa  257  7e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  30.28 
 
 
813 aa  255  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  30.41 
 
 
967 aa  254  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  30.03 
 
 
979 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.07 
 
 
979 aa  244  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  32.02 
 
 
967 aa  239  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  29.7 
 
 
980 aa  238  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  29.64 
 
 
987 aa  233  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  31.18 
 
 
475 aa  143  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  31.84 
 
 
773 aa  140  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  27.3 
 
 
459 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  29.12 
 
 
469 aa  124  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  31.46 
 
 
558 aa  124  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  27.98 
 
 
606 aa  121  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  25.34 
 
 
536 aa  121  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  28.22 
 
 
797 aa  119  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  28.09 
 
 
581 aa  118  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  30.81 
 
 
556 aa  118  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  27.98 
 
 
607 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  29.7 
 
 
776 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  28.29 
 
 
462 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  28.75 
 
 
802 aa  112  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  27.41 
 
 
385 aa  112  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  29.4 
 
 
783 aa  110  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  30.16 
 
 
804 aa  108  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  29.41 
 
 
524 aa  108  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  29.16 
 
 
629 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  28.07 
 
 
771 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  29.57 
 
 
760 aa  105  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  29.52 
 
 
811 aa  105  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  29.07 
 
 
760 aa  105  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  25.71 
 
 
643 aa  103  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  26.29 
 
 
1137 aa  102  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  27.59 
 
 
560 aa  101  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  27.3 
 
 
560 aa  101  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  26.32 
 
 
787 aa  98.2  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  26.72 
 
 
398 aa  98.2  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  27.93 
 
 
825 aa  98.2  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  26.72 
 
 
560 aa  97.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  30.86 
 
 
860 aa  97.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  27.93 
 
 
829 aa  96.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  26.72 
 
 
560 aa  96.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  26.72 
 
 
560 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1062  type III restriction enzyme, res subunit  27.46 
 
 
1138 aa  95.9  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  28.45 
 
 
545 aa  95.9  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  26.15 
 
 
560 aa  95.1  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  27.87 
 
 
545 aa  94.7  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  26.97 
 
 
796 aa  94.7  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  26.44 
 
 
809 aa  94  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  27.62 
 
 
824 aa  93.2  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  25.47 
 
 
899 aa  93.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  26.54 
 
 
1141 aa  92  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  28.17 
 
 
545 aa  91.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  27.3 
 
 
784 aa  91.7  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  27.3 
 
 
784 aa  91.7  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>