More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3048 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  91.01 
 
 		 545 aa  997    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  100 
 
 		 545 aa  1081    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  61.51 
 
 		 569 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  98.17 
 
 		 545 aa  1063    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  65.34 
 
 		 550 aa  684    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  47.76 
 
 		 538 aa  472  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  36.91 
 
 		 583 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  39.14 
 
 		 613 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  36.41 
 
 		 583 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.16 
 
 		 657 aa  229  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  37.41 
 
 		 585 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  36.82 
 
 		 585 aa  228  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  35.91 
 
 		 574 aa  227  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  35.82 
 
 		 597 aa  226  9e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  36.31 
 
 		 586 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  37.93 
 
 		 585 aa  223  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  37.93 
 
 		 585 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  37.93 
 
 		 585 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  35.4 
 
 		 586 aa  219  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  35.4 
 
 		 586 aa  219  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  34 
 
 		 584 aa  219  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  37.13 
 
 		 586 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  35.15 
 
 		 586 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  36.86 
 
 		 586 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  36.86 
 
 		 586 aa  216  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  35.15 
 
 		 586 aa  216  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  36.86 
 
 		 586 aa  216  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  36.18 
 
 		 586 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  35.93 
 
 		 586 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  35.68 
 
 		 586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  34.89 
 
 		 591 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  34.41 
 
 		 586 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  34.16 
 
 		 586 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  34.16 
 
 		 586 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  35.99 
 
 		 590 aa  213  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  36.07 
 
 		 590 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  33.91 
 
 		 586 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  35.25 
 
 		 579 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  35.07 
 
 		 580 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  33.91 
 
 		 586 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  35.16 
 
 		 586 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  34.89 
 
 		 590 aa  207  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  35.41 
 
 		 602 aa  206  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  31.17 
 
 		 583 aa  206  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  35.16 
 
 		 590 aa  206  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  34.6 
 
 		 580 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  36.22 
 
 		 584 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  35.07 
 
 		 616 aa  204  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  34.83 
 
 		 588 aa  203  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  35.58 
 
 		 584 aa  203  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  35.95 
 
 		 584 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  35.68 
 
 		 584 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  34.25 
 
 		 580 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  32.62 
 
 		 475 aa  162  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  32.56 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  32.2 
 
 		 581 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  32.69 
 
 		 469 aa  154  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  28.85 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  28.1 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  29.29 
 
 		 560 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  27.89 
 
 		 560 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  29.01 
 
 		 678 aa  143  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  28.85 
 
 		 560 aa  143  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  28.67 
 
 		 560 aa  143  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  29.64 
 
 		 967 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  28.67 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  28.73 
 
 		 643 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  27.9 
 
 		 848 aa  137  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  28.93 
 
 		 629 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  25.89 
 
 		 993 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  29.09 
 
 		 536 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  29.17 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  30.69 
 
 		 607 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  28.49 
 
 		 385 aa  126  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  30.32 
 
 		 606 aa  126  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  28.4 
 
 		 706 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  29.36 
 
 		 1052 aa  123  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  29.95 
 
 		 1066 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  29.85 
 
 		 1418 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.89 
 
 		 504 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  25.75 
 
 		 952 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  28.95 
 
 		 773 aa  120  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  27.58 
 
 		 967 aa  118  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.73 
 
 		 979 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  30.21 
 
 		 1348 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  28.64 
 
 		 1033 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  26.92 
 
 		 1017 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 938 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.93 
 
 		 1031 aa  114  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  29.59 
 
 		 1033 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  28.82 
 
 		 1077 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  29.23 
 
 		 1029 aa  113  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  28.65 
 
 		 987 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  29.32 
 
 		 1033 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  26.18 
 
 		 905 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  25.56 
 
 		 813 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  25.18 
 
 		 953 aa  110  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  25.18 
 
 		 953 aa  110  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  27.25 
 
 		 1062 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  25.88 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>