More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2475 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 475 aa  971    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  46.57 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  46.35 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  40.38 
 
 		 459 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  37.25 
 
 		 629 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.92 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  32.57 
 
 		 550 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  33.41 
 
 		 560 aa  189  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  35.01 
 
 		 536 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  32.17 
 
 		 560 aa  186  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  32.69 
 
 		 560 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  31.87 
 
 		 560 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  36.03 
 
 		 581 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  31.05 
 
 		 538 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  31.87 
 
 		 560 aa  176  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  31.87 
 
 		 560 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  30.88 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  34.17 
 
 		 1033 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  32.98 
 
 		 398 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  34.73 
 
 		 1033 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  29.1 
 
 		 813 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  31.81 
 
 		 848 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  33.24 
 
 		 569 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  29.75 
 
 		 812 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  33.16 
 
 		 545 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  33.8 
 
 		 1065 aa  163  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  28.82 
 
 		 815 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  34.81 
 
 		 938 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  32.62 
 
 		 545 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  33.16 
 
 		 545 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  29.77 
 
 		 583 aa  160  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  33.82 
 
 		 1077 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  28.78 
 
 		 993 aa  160  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  29.36 
 
 		 583 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  31.25 
 
 		 773 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  31.34 
 
 		 1051 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  33.9 
 
 		 1028 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  31.45 
 
 		 586 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.82 
 
 		 1031 aa  156  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  28.49 
 
 		 1053 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  28.85 
 
 		 586 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  30.28 
 
 		 1052 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  32.32 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  34.82 
 
 		 1287 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  31.01 
 
 		 586 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  31.01 
 
 		 586 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  31.22 
 
 		 586 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 1066 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  30.42 
 
 		 979 aa  154  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  32.53 
 
 		 1061 aa  153  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  34.01 
 
 		 606 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  30 
 
 		 967 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  30.25 
 
 		 1149 aa  153  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  31.65 
 
 		 1041 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  31 
 
 		 586 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  31.61 
 
 		 1029 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  30.25 
 
 		 1062 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  31.16 
 
 		 1055 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  35.08 
 
 		 928 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  32.7 
 
 		 643 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  29.89 
 
 		 905 aa  150  5e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  31.84 
 
 		 1033 aa  150  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  31 
 
 		 512 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  34.77 
 
 		 956 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  28.84 
 
 		 949 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  32.54 
 
 		 1063 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.17 
 
 		 974 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  30.05 
 
 		 574 aa  148  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  29.57 
 
 		 586 aa  148  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  29.34 
 
 		 967 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  28.98 
 
 		 946 aa  148  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  29.73 
 
 		 586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  30.25 
 
 		 591 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  29.73 
 
 		 586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  29.73 
 
 		 586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  30.86 
 
 		 1055 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.54 
 
 		 657 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  29.73 
 
 		 586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  29.73 
 
 		 586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  30.86 
 
 		 1055 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  29.73 
 
 		 586 aa  147  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  29.73 
 
 		 586 aa  147  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  30.54 
 
 		 982 aa  146  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  30.2 
 
 		 1043 aa  146  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  28.63 
 
 		 586 aa  146  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  29.4 
 
 		 586 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  30.73 
 
 		 1042 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  33.68 
 
 		 607 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  30.03 
 
 		 1017 aa  144  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  29.89 
 
 		 585 aa  143  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  31.18 
 
 		 1042 aa  143  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  30.34 
 
 		 585 aa  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  30.34 
 
 		 585 aa  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  32.23 
 
 		 1051 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  32.34 
 
 		 1348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  28 
 
 		 586 aa  141  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 524 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  27.04 
 
 		 585 aa  140  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  30.28 
 
 		 613 aa  139  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  30.1 
 
 		 602 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>