More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88383 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 385 aa  797    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  40.81 
 
 		 643 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  35.68 
 
 		 706 aa  231  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  33.43 
 
 		 462 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  34.92 
 
 		 536 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  33.14 
 
 		 581 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  32.23 
 
 		 967 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  33.81 
 
 		 1287 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  32.28 
 
 		 1077 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  34.22 
 
 		 987 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  29.81 
 
 		 812 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  31.34 
 
 		 813 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  30 
 
 		 938 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  32.32 
 
 		 475 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  31.88 
 
 		 469 aa  162  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  29.86 
 
 		 815 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.09 
 
 		 979 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  32.88 
 
 		 629 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  32.39 
 
 		 1418 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  30.99 
 
 		 1053 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  31.63 
 
 		 1052 aa  156  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  29.46 
 
 		 979 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  29.03 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  32.8 
 
 		 607 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  31.44 
 
 		 1043 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  33.14 
 
 		 1348 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  32.34 
 
 		 956 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  32.37 
 
 		 606 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  31.94 
 
 		 928 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  29.67 
 
 		 905 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  30.41 
 
 		 993 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  29.51 
 
 		 848 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 524 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  30.6 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  29.1 
 
 		 967 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  30.6 
 
 		 560 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  30.6 
 
 		 560 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  31.09 
 
 		 560 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  28.88 
 
 		 1033 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  30.33 
 
 		 560 aa  143  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  29.76 
 
 		 1033 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  29.62 
 
 		 1066 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  31 
 
 		 560 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  30.65 
 
 		 590 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  30.5 
 
 		 560 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  29.04 
 
 		 1033 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  28.68 
 
 		 1017 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  26.89 
 
 		 982 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  30.38 
 
 		 590 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 		 1058 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.4 
 
 		 1031 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  29.3 
 
 		 584 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 		 1055 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  27.34 
 
 		 1055 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  28.92 
 
 		 1051 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  30.99 
 
 		 1035 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  29.23 
 
 		 545 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  28.01 
 
 		 1051 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  30.11 
 
 		 590 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  29.14 
 
 		 580 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 		 1055 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  31.94 
 
 		 510 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  31.82 
 
 		 597 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  29.03 
 
 		 584 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  28.31 
 
 		 1061 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  28.09 
 
 		 602 aa  133  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  29.11 
 
 		 1029 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  27.91 
 
 		 1063 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  28.76 
 
 		 584 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  28.76 
 
 		 584 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  29.47 
 
 		 773 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  29.97 
 
 		 580 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.13 
 
 		 504 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  28.92 
 
 		 545 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  28.92 
 
 		 545 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  29.14 
 
 		 590 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  29.71 
 
 		 1028 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  27.76 
 
 		 550 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  27.3 
 
 		 1065 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  30.63 
 
 		 583 aa  126  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  30.67 
 
 		 586 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.88 
 
 		 974 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  29.92 
 
 		 586 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  26.92 
 
 		 1041 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  28.8 
 
 		 588 aa  123  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  28.68 
 
 		 574 aa  122  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  28.13 
 
 		 952 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  29.32 
 
 		 583 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  28.57 
 
 		 613 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  29.4 
 
 		 586 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  28.99 
 
 		 616 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  29.58 
 
 		 586 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  28.09 
 
 		 591 aa  119  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  29.19 
 
 		 1149 aa  119  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  29.22 
 
 		 579 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  26.61 
 
 		 580 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.41 
 
 		 657 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  29.02 
 
 		 585 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  29.32 
 
 		 586 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  29.32 
 
 		 586 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>