More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1908 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  77.82 
 
 		 586 aa  961    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  77.82 
 
 		 586 aa  961    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  81.68 
 
 		 585 aa  1005    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  77.82 
 
 		 586 aa  963    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 586 aa  1217    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  81.68 
 
 		 585 aa  1005    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  77.99 
 
 		 586 aa  972    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  77.99 
 
 		 586 aa  972    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  82.19 
 
 		 585 aa  1003    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  77.99 
 
 		 586 aa  972    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  77.65 
 
 		 586 aa  959    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  95.39 
 
 		 586 aa  1170    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  61.09 
 
 		 613 aa  729    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  81.51 
 
 		 585 aa  1004    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  52.73 
 
 		 586 aa  644    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  56.87 
 
 		 583 aa  697    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  80.72 
 
 		 586 aa  999    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  56.92 
 
 		 583 aa  692    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  77.99 
 
 		 586 aa  964    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  77.82 
 
 		 586 aa  961    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  77.82 
 
 		 586 aa  969    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  77.82 
 
 		 586 aa  969    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  77.65 
 
 		 586 aa  960    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  81.39 
 
 		 591 aa  1013    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  55.75 
 
 		 584 aa  680    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  76.45 
 
 		 586 aa  957    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  55.94 
 
 		 574 aa  667    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  58.97 
 
 		 585 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  77.47 
 
 		 586 aa  961    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  59.09 
 
 		 657 aa  708    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  53.97 
 
 		 583 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  54.27 
 
 		 590 aa  629  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  54.02 
 
 		 602 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  51.51 
 
 		 597 aa  627  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  53.74 
 
 		 584 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  54.43 
 
 		 579 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  53.74 
 
 		 584 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  52.23 
 
 		 616 aa  622  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  53.74 
 
 		 584 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  53.58 
 
 		 590 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  53.66 
 
 		 584 aa  621  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  53.41 
 
 		 590 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  53.07 
 
 		 590 aa  616  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  52.92 
 
 		 580 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  53.45 
 
 		 588 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  50.35 
 
 		 580 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  50.43 
 
 		 580 aa  586  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  35.12 
 
 		 678 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  31.15 
 
 		 538 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  36.18 
 
 		 545 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  36.18 
 
 		 545 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  35.05 
 
 		 545 aa  213  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  36.72 
 
 		 569 aa  210  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  34.9 
 
 		 550 aa  209  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  31.19 
 
 		 560 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  30.45 
 
 		 560 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  30.45 
 
 		 560 aa  150  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  30.2 
 
 		 560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  30.2 
 
 		 560 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  29.95 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  32.8 
 
 		 581 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  30.83 
 
 		 398 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  32.02 
 
 		 606 aa  143  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  28 
 
 		 475 aa  141  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  31.6 
 
 		 607 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  31.94 
 
 		 536 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  27.62 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  29.65 
 
 		 629 aa  127  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  28.26 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  30.14 
 
 		 462 aa  123  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.23 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  27.69 
 
 		 539 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  28.8 
 
 		 967 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  28.75 
 
 		 706 aa  117  7.999999999999999e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  27.27 
 
 		 643 aa  114  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  29.02 
 
 		 1066 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  29.4 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  29.53 
 
 		 1077 aa  112  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  26.54 
 
 		 967 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  26.61 
 
 		 813 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  27.11 
 
 		 815 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  26.74 
 
 		 812 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  28.61 
 
 		 558 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  26.53 
 
 		 848 aa  107  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  26.29 
 
 		 502 aa  107  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  28.31 
 
 		 938 aa  107  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  30.62 
 
 		 1287 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  27.17 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8690  putative helicase  29.33 
 
 		 469 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  29.16 
 
 		 787 aa  103  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  26.96 
 
 		 993 aa  103  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 1055 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  30.73 
 
 		 1028 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  29.91 
 
 		 1348 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  28.49 
 
 		 1017 aa  101  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  28.29 
 
 		 1055 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  28.29 
 
 		 1055 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.47 
 
 		 974 aa  99.8  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  28 
 
 		 982 aa  98.6  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>