More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2440 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  76.31 
 
 		 586 aa  949    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  76.31 
 
 		 586 aa  949    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  76.31 
 
 		 586 aa  949    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  78.95 
 
 		 585 aa  984    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  76.31 
 
 		 586 aa  949    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  77.33 
 
 		 586 aa  968    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  81.39 
 
 		 586 aa  1014    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  53.14 
 
 		 586 aa  661    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  76.14 
 
 		 586 aa  946    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  55.46 
 
 		 574 aa  655    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  77.66 
 
 		 586 aa  971    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  78.95 
 
 		 585 aa  984    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  76.48 
 
 		 586 aa  952    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  56.6 
 
 		 583 aa  686    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  76.99 
 
 		 586 aa  959    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  60.86 
 
 		 613 aa  726    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  78.95 
 
 		 585 aa  984    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  52.42 
 
 		 597 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  59.1 
 
 		 657 aa  699    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  77.5 
 
 		 586 aa  969    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  82.57 
 
 		 586 aa  1024    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  77.33 
 
 		 586 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  56.8 
 
 		 583 aa  692    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  79.29 
 
 		 585 aa  977    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  77.33 
 
 		 586 aa  968    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  76.48 
 
 		 586 aa  952    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  81.39 
 
 		 586 aa  1013    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  55.27 
 
 		 584 aa  673    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 591 aa  1225    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  76.48 
 
 		 586 aa  952    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  59.46 
 
 		 585 aa  698    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  53.96 
 
 		 584 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  53.96 
 
 		 584 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  53.79 
 
 		 584 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  53.56 
 
 		 602 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  53.55 
 
 		 584 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  53.13 
 
 		 590 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  52.79 
 
 		 590 aa  620  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  52.45 
 
 		 590 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  52.28 
 
 		 590 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  52.48 
 
 		 583 aa  616  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  52.13 
 
 		 580 aa  615  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  52.59 
 
 		 579 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  54.02 
 
 		 588 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  50.94 
 
 		 616 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  50.95 
 
 		 580 aa  601  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  51.11 
 
 		 580 aa  597  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  34.31 
 
 		 678 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  36.74 
 
 		 538 aa  237  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  35.87 
 
 		 545 aa  217  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  35.38 
 
 		 545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  34.29 
 
 		 545 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  36.03 
 
 		 569 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  33.82 
 
 		 550 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  30.25 
 
 		 475 aa  147  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  31.56 
 
 		 581 aa  145  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  31.96 
 
 		 606 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  31.69 
 
 		 607 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  27.93 
 
 		 560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  27.8 
 
 		 560 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  31.15 
 
 		 536 aa  135  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  27.57 
 
 		 560 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  27.44 
 
 		 560 aa  133  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  27.44 
 
 		 560 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  30.59 
 
 		 629 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  27.29 
 
 		 462 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  29.21 
 
 		 398 aa  130  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  28.47 
 
 		 560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  29.21 
 
 		 469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  27.47 
 
 		 643 aa  124  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  27.16 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  28.9 
 
 		 967 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.38 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  28.65 
 
 		 524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  27.03 
 
 		 813 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  27.11 
 
 		 385 aa  114  7.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  26.43 
 
 		 949 aa  111  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  26.5 
 
 		 848 aa  110  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  29.04 
 
 		 1077 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  26.32 
 
 		 815 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  25.75 
 
 		 706 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  26.41 
 
 		 502 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  27.9 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  26.86 
 
 		 993 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  28.99 
 
 		 558 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  28.8 
 
 		 938 aa  104  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  27.62 
 
 		 787 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8690  putative helicase  29.46 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  27.11 
 
 		 812 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  26.08 
 
 		 539 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  25.87 
 
 		 510 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  26.37 
 
 		 773 aa  100  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  25.54 
 
 		 797 aa  100  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  26.96 
 
 		 967 aa  100  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  27.37 
 
 		 1029 aa  98.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  27.64 
 
 		 1287 aa  98.2  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  27.23 
 
 		 1066 aa  98.2  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.59 
 
 		 974 aa  97.4  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  27.98 
 
 		 1053 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  27.76 
 
 		 1017 aa  95.9  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>