More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8690 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8690  putative helicase  100 
 
 		 469 aa  934    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0594  type III restriction protein res subunit  46.6 
 
 		 525 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  42.66 
 
 		 539 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 581 aa  136  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3708  helicase-like  33.44 
 
 		 295 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  28.17 
 
 		 773 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  31.82 
 
 		 584 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  31.83 
 
 		 584 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  31.56 
 
 		 584 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  31.44 
 
 		 590 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  31.5 
 
 		 602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  31.87 
 
 		 590 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  31.3 
 
 		 584 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  31.44 
 
 		 590 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.8 
 
 		 504 aa  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  30.03 
 
 		 586 aa  113  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  32.95 
 
 		 607 aa  110  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  31.9 
 
 		 606 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  29.68 
 
 		 586 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  30.75 
 
 		 590 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  28.8 
 
 		 597 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  31.4 
 
 		 585 aa  106  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  31.4 
 
 		 585 aa  106  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  31.4 
 
 		 585 aa  106  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  28.13 
 
 		 643 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  28.01 
 
 		 574 aa  104  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  29.33 
 
 		 586 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  27.49 
 
 		 706 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  29.6 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  29.46 
 
 		 591 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  29.6 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  29.6 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  30.4 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  27.78 
 
 		 584 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  28.08 
 
 		 585 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  29.95 
 
 		 580 aa  101  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  29.33 
 
 		 586 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  29.6 
 
 		 586 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  29.87 
 
 		 586 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  29.87 
 
 		 586 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  29.6 
 
 		 586 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  29.87 
 
 		 586 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  29.87 
 
 		 586 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  29.87 
 
 		 586 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  29.79 
 
 		 586 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  29.47 
 
 		 588 aa  99.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  27.56 
 
 		 629 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  28.42 
 
 		 616 aa  98.6  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  29.6 
 
 		 586 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  28.84 
 
 		 583 aa  97.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  27.82 
 
 		 583 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  29.79 
 
 		 586 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  28.8 
 
 		 580 aa  94.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  26.94 
 
 		 459 aa  93.2  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  25.69 
 
 		 510 aa  93.2  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  30.16 
 
 		 560 aa  93.2  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  27.39 
 
 		 583 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  27.45 
 
 		 657 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  29.07 
 
 		 585 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  30.43 
 
 		 560 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  25.27 
 
 		 538 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  26.94 
 
 		 1051 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  28.42 
 
 		 560 aa  91.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  28.57 
 
 		 613 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  27.39 
 
 		 545 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  28.99 
 
 		 580 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  24.4 
 
 		 953 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  24.4 
 
 		 953 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  26.65 
 
 		 536 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  29.33 
 
 		 475 aa  87.4  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  28.04 
 
 		 545 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  30.67 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  25.27 
 
 		 812 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  27.93 
 
 		 545 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  30.41 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  30.7 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  27.76 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  28.34 
 
 		 579 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  30.7 
 
 		 560 aa  84.7  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  30.08 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  25.91 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  28.3 
 
 		 550 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  24.36 
 
 		 1005 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  28.46 
 
 		 1028 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  24.67 
 
 		 813 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  28.33 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  26.09 
 
 		 502 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  24.03 
 
 		 842 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  24.16 
 
 		 905 aa  80.1  0.00000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  27.59 
 
 		 1287 aa  79.7  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  27.92 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.93 
 
 		 974 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  27.15 
 
 		 1063 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  29.81 
 
 		 1348 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  22.77 
 
 		 952 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  27.86 
 
 		 1033 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  24.75 
 
 		 678 aa  76.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  29.65 
 
 		 1418 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  22.46 
 
 		 946 aa  76.6  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1302  putative helicase  27.85 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>