More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1295 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  54.96 
 
 		 586 aa  672    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  54.96 
 
 		 586 aa  672    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  54.96 
 
 		 586 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  54.96 
 
 		 586 aa  673    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  55.75 
 
 		 586 aa  680    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  54.96 
 
 		 586 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  54.78 
 
 		 586 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  55.23 
 
 		 586 aa  676    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  55.27 
 
 		 591 aa  673    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  53.31 
 
 		 586 aa  659    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  67.64 
 
 		 583 aa  835    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  54.96 
 
 		 586 aa  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  55.92 
 
 		 586 aa  679    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  54.78 
 
 		 586 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  54.3 
 
 		 613 aa  650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  67.02 
 
 		 574 aa  818    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  54.37 
 
 		 585 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  54.36 
 
 		 585 aa  661    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  67.3 
 
 		 583 aa  833    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  54.96 
 
 		 586 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  54.37 
 
 		 585 aa  662    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  54.96 
 
 		 586 aa  672    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  67.54 
 
 		 657 aa  838    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  54.37 
 
 		 585 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 584 aa  1217    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  54.78 
 
 		 586 aa  672    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  54.96 
 
 		 586 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  54.96 
 
 		 586 aa  672    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  52.48 
 
 		 585 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  49.91 
 
 		 588 aa  561  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  47.74 
 
 		 586 aa  561  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  48.12 
 
 		 616 aa  556  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  46.23 
 
 		 597 aa  555  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  46.85 
 
 		 579 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  47.74 
 
 		 583 aa  544  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  47 
 
 		 590 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  47.16 
 
 		 580 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  46.83 
 
 		 590 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  46.83 
 
 		 590 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  46.74 
 
 		 590 aa  528  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  46.22 
 
 		 602 aa  525  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  46.39 
 
 		 584 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  46.39 
 
 		 584 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  46.22 
 
 		 584 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  46.39 
 
 		 584 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  46.35 
 
 		 580 aa  528  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  45.61 
 
 		 580 aa  521  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  35.64 
 
 		 538 aa  238  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  31.29 
 
 		 678 aa  229  8e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  34.49 
 
 		 545 aa  223  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  34.25 
 
 		 545 aa  221  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  34 
 
 		 545 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  32.43 
 
 		 550 aa  204  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  32.88 
 
 		 569 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 		 475 aa  137  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  29.71 
 
 		 606 aa  137  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  29.23 
 
 		 581 aa  136  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  30.69 
 
 		 607 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  30.19 
 
 		 629 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  30.65 
 
 		 560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.91 
 
 		 504 aa  127  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  29.95 
 
 		 560 aa  127  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  30.21 
 
 		 560 aa  127  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  29.68 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  29.68 
 
 		 560 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  29.95 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  29.07 
 
 		 560 aa  124  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  29.82 
 
 		 539 aa  123  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  29.04 
 
 		 536 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  26.05 
 
 		 643 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  27.05 
 
 		 813 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  26.5 
 
 		 1053 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  25.95 
 
 		 510 aa  107  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  29.41 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  26.3 
 
 		 967 aa  105  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  27.63 
 
 		 1418 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  26.91 
 
 		 905 aa  103  6e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  24.11 
 
 		 502 aa  103  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  27.97 
 
 		 385 aa  103  9e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  27.01 
 
 		 1058 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  26.63 
 
 		 812 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  26.09 
 
 		 848 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8690  putative helicase  27.78 
 
 		 469 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  26.18 
 
 		 524 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  28.53 
 
 		 1055 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  27.76 
 
 		 1052 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  26.68 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  28.61 
 
 		 1055 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  27.83 
 
 		 1063 aa  100  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  28.61 
 
 		 1055 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  25.81 
 
 		 787 aa  99.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  27.47 
 
 		 1066 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  26.08 
 
 		 556 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0594  type III restriction protein res subunit  28.99 
 
 		 525 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  24.44 
 
 		 773 aa  97.8  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  26.65 
 
 		 1017 aa  97.8  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  25.57 
 
 		 512 aa  97.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  24.29 
 
 		 804 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  26.54 
 
 		 1029 aa  95.9  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  27.54 
 
 		 1051 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>