More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2333 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  99.15 
 
 		 586 aa  1206    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  95.22 
 
 		 586 aa  1168    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  99.15 
 
 		 586 aa  1206    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  60.38 
 
 		 657 aa  728    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  57.49 
 
 		 583 aa  706    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  78.25 
 
 		 585 aa  970    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  99.49 
 
 		 586 aa  1211    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  54.92 
 
 		 590 aa  638    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  98.98 
 
 		 586 aa  1203    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  99.15 
 
 		 586 aa  1206    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  55.21 
 
 		 602 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  76.48 
 
 		 591 aa  952    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  54.93 
 
 		 584 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  94.88 
 
 		 586 aa  1164    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  56.72 
 
 		 574 aa  682    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  63.29 
 
 		 613 aa  745    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  55.27 
 
 		 584 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  77.3 
 
 		 586 aa  961    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  52.61 
 
 		 597 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  99.15 
 
 		 586 aa  1206    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  54.66 
 
 		 590 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  54.66 
 
 		 590 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  78.94 
 
 		 585 aa  984    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  54.33 
 
 		 583 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  53.42 
 
 		 586 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  54.83 
 
 		 590 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  95.05 
 
 		 586 aa  1166    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  89.93 
 
 		 586 aa  1107    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  94.88 
 
 		 586 aa  1164    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  54.78 
 
 		 584 aa  672    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  78.42 
 
 		 585 aa  972    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  95.22 
 
 		 586 aa  1168    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  76.28 
 
 		 586 aa  956    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  78.42 
 
 		 585 aa  972    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  60.41 
 
 		 585 aa  724    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  77.47 
 
 		 586 aa  961    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  100 
 
 		 586 aa  1214    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  57.46 
 
 		 583 aa  708    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  55.4 
 
 		 584 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  98.98 
 
 		 586 aa  1202    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  54.93 
 
 		 584 aa  644    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  53.7 
 
 		 579 aa  630  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  53.65 
 
 		 580 aa  626  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  52.31 
 
 		 616 aa  626  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  55.86 
 
 		 588 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  52.95 
 
 		 580 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  52.32 
 
 		 580 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  34.33 
 
 		 678 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  35.47 
 
 		 538 aa  226  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  36.03 
 
 		 550 aa  224  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  36.14 
 
 		 545 aa  221  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  35.4 
 
 		 545 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  35.15 
 
 		 545 aa  217  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  36.43 
 
 		 569 aa  213  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  32.43 
 
 		 581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  32.97 
 
 		 536 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  29.73 
 
 		 475 aa  147  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  31.81 
 
 		 560 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  31.37 
 
 		 560 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  31.64 
 
 		 560 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  31.64 
 
 		 560 aa  144  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  31.2 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  30.83 
 
 		 560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  30.83 
 
 		 560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  31.27 
 
 		 629 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  30.71 
 
 		 469 aa  140  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  31.66 
 
 		 606 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  31.93 
 
 		 607 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  31.08 
 
 		 462 aa  128  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  29.38 
 
 		 643 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.26 
 
 		 504 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  26.3 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  29.49 
 
 		 556 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  27.87 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  28.61 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  26.67 
 
 		 812 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  27.12 
 
 		 848 aa  110  8.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  26.46 
 
 		 706 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  29.02 
 
 		 1066 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  28.97 
 
 		 787 aa  109  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  28.5 
 
 		 1058 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  29.73 
 
 		 558 aa  108  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  28.12 
 
 		 385 aa  108  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  26.26 
 
 		 974 aa  107  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  28.49 
 
 		 967 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  30.48 
 
 		 1348 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  25.89 
 
 		 813 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  26.77 
 
 		 905 aa  104  6e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  27.39 
 
 		 1077 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  28.18 
 
 		 1053 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  27.91 
 
 		 938 aa  101  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  28.65 
 
 		 1287 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  28.42 
 
 		 1065 aa  101  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  28.09 
 
 		 1418 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.97 
 
 		 783 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  25.94 
 
 		 510 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  26.19 
 
 		 1052 aa  100  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  26.17 
 
 		 773 aa  99.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  24.75 
 
 		 797 aa  99  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8690  putative helicase  29.6 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>