More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003782 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  57.49 
 
 		 586 aa  706    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  57.49 
 
 		 586 aa  706    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  56.92 
 
 		 586 aa  693    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  57.49 
 
 		 586 aa  707    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  57.66 
 
 		 586 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  56.92 
 
 		 585 aa  691    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  57.66 
 
 		 586 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  56.92 
 
 		 585 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  57.17 
 
 		 586 aa  695    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  95.88 
 
 		 583 aa  1179    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  55.76 
 
 		 613 aa  669    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  57.49 
 
 		 586 aa  707    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  57.27 
 
 		 585 aa  695    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  57.83 
 
 		 586 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  100 
 
 		 583 aa  1217    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  57.49 
 
 		 586 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  57.49 
 
 		 586 aa  706    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  56.92 
 
 		 585 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  57.49 
 
 		 586 aa  706    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  56.92 
 
 		 586 aa  692    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  56.6 
 
 		 591 aa  686    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  83.16 
 
 		 657 aa  1036    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  67.64 
 
 		 584 aa  835    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  77.93 
 
 		 574 aa  942    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  58.45 
 
 		 586 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  57.83 
 
 		 586 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  54.97 
 
 		 585 aa  641    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  57.49 
 
 		 586 aa  706    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  57.49 
 
 		 586 aa  706    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  51.29 
 
 		 579 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  48.98 
 
 		 597 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  50.17 
 
 		 588 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  50.43 
 
 		 590 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  50.09 
 
 		 590 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  49.91 
 
 		 590 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  48.8 
 
 		 586 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  49.13 
 
 		 583 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  48.62 
 
 		 584 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  49.31 
 
 		 590 aa  557  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  47.95 
 
 		 616 aa  556  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  48.36 
 
 		 602 aa  555  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  48.62 
 
 		 584 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  48.62 
 
 		 584 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  48.36 
 
 		 580 aa  554  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  48.79 
 
 		 584 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  48.53 
 
 		 580 aa  551  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  48.1 
 
 		 580 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  34.58 
 
 		 678 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  37.31 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  37.66 
 
 		 545 aa  241  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  37.66 
 
 		 545 aa  240  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  36.91 
 
 		 545 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  34.57 
 
 		 550 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  35.61 
 
 		 569 aa  217  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  29.36 
 
 		 475 aa  160  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  31.08 
 
 		 581 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  30.03 
 
 		 536 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  28.78 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  29.14 
 
 		 560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  28.64 
 
 		 560 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  30.73 
 
 		 629 aa  133  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  29.31 
 
 		 560 aa  133  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  31.48 
 
 		 469 aa  133  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  29.06 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  29.06 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  29.52 
 
 		 398 aa  130  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.99 
 
 		 504 aa  130  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  28.15 
 
 		 560 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  29.52 
 
 		 606 aa  127  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  28 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  28.74 
 
 		 848 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  29.02 
 
 		 607 aa  120  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  28.65 
 
 		 938 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  28.98 
 
 		 967 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  30.26 
 
 		 1043 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  25.78 
 
 		 502 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  29.72 
 
 		 1077 aa  114  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  28.7 
 
 		 812 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  26.68 
 
 		 813 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  28.07 
 
 		 993 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  27.41 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  28.57 
 
 		 1052 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 1055 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11338  hypothetical protein  27.39 
 
 		 503 aa  109  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  29.32 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  26.86 
 
 		 1017 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  25.63 
 
 		 773 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  26.52 
 
 		 1053 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  28.69 
 
 		 1055 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  28.69 
 
 		 1055 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  27.2 
 
 		 539 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  28.77 
 
 		 1348 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  26.5 
 
 		 905 aa  107  8e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  28.12 
 
 		 1028 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  28.23 
 
 		 1066 aa  105  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  29.47 
 
 		 1058 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  28.41 
 
 		 982 aa  104  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  28.86 
 
 		 1061 aa  104  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  28.23 
 
 		 815 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  26.45 
 
 		 967 aa  103  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>