More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6521 on replicon NC_010507
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 462 aa  913    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  46.36 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  46.35 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  39.79 
 
 		 459 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.43 
 
 		 504 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  32.69 
 
 		 629 aa  236  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  33.17 
 
 		 502 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  31.75 
 
 		 385 aa  182  9.000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  31.91 
 
 		 536 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  35.98 
 
 		 581 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  35.61 
 
 		 938 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  30.54 
 
 		 560 aa  169  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  30.3 
 
 		 560 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  32.52 
 
 		 550 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  30.3 
 
 		 560 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  33.62 
 
 		 545 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  30.49 
 
 		 560 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  32.02 
 
 		 398 aa  167  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  29.9 
 
 		 560 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  30.45 
 
 		 813 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  30.39 
 
 		 560 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  28.08 
 
 		 848 aa  164  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  34.95 
 
 		 545 aa  163  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  34.18 
 
 		 607 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  33.57 
 
 		 569 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  33.13 
 
 		 1051 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  30.79 
 
 		 815 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  35.5 
 
 		 1077 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  34.38 
 
 		 1287 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  29.46 
 
 		 812 aa  156  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  33.98 
 
 		 545 aa  156  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  33.06 
 
 		 606 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  29.24 
 
 		 967 aa  154  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  29.55 
 
 		 512 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  32.24 
 
 		 1063 aa  153  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  35.95 
 
 		 928 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  35.44 
 
 		 956 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  30.34 
 
 		 706 aa  151  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  33.74 
 
 		 1028 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11338  hypothetical protein  28.69 
 
 		 503 aa  150  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  26.9 
 
 		 993 aa  150  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  31.88 
 
 		 1033 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  31.88 
 
 		 1033 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  32.89 
 
 		 1029 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  30.42 
 
 		 643 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  29.48 
 
 		 773 aa  147  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  28.7 
 
 		 1062 aa  147  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  34.57 
 
 		 524 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  29.55 
 
 		 967 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.05 
 
 		 974 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  32.02 
 
 		 1055 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  34.03 
 
 		 1348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  28.49 
 
 		 510 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  28.99 
 
 		 583 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  27.4 
 
 		 538 aa  139  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.97 
 
 		 979 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  30.66 
 
 		 1033 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.32 
 
 		 657 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  28.78 
 
 		 583 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  30.37 
 
 		 1066 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  28.57 
 
 		 1052 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  31.42 
 
 		 1055 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  30.13 
 
 		 586 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  31.42 
 
 		 1055 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  29.61 
 
 		 1061 aa  136  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  25.86 
 
 		 1053 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  28.09 
 
 		 905 aa  134  3e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  30.58 
 
 		 982 aa  133  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  29.91 
 
 		 987 aa  133  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  31.35 
 
 		 586 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  32.45 
 
 		 1418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  29.91 
 
 		 1051 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  28.14 
 
 		 586 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  30.42 
 
 		 1058 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  29.18 
 
 		 979 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.24 
 
 		 1031 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  30.61 
 
 		 1041 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  27.29 
 
 		 591 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  29.55 
 
 		 1017 aa  130  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  31.08 
 
 		 586 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  31.08 
 
 		 586 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  31.08 
 
 		 586 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  29.92 
 
 		 574 aa  129  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  31.08 
 
 		 586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  31.08 
 
 		 586 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  30.81 
 
 		 586 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  30.81 
 
 		 586 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  30.39 
 
 		 585 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  30.54 
 
 		 586 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  32.02 
 
 		 1035 aa  127  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  30.54 
 
 		 586 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  28.95 
 
 		 597 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  30.54 
 
 		 586 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  28.25 
 
 		 590 aa  126  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  27.69 
 
 		 602 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  25.14 
 
 		 949 aa  126  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  30.54 
 
 		 586 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  31.4 
 
 		 585 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  30.54 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  28.25 
 
 		 590 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>