More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0977 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  38.07 
 
 
1041 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  37.77 
 
 
1042 aa  665    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  39.09 
 
 
1017 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  38.68 
 
 
982 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  46.44 
 
 
1035 aa  858    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  52.54 
 
 
1028 aa  1046    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  37.73 
 
 
1055 aa  677    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  40.81 
 
 
1033 aa  700    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  47.44 
 
 
1031 aa  923    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  37.16 
 
 
1051 aa  653    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  39.16 
 
 
1066 aa  652    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  89.91 
 
 
1051 aa  1955    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  44.75 
 
 
1029 aa  804    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  40.81 
 
 
1033 aa  696    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  36.89 
 
 
1061 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 
1063 aa  2182    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  37.28 
 
 
1042 aa  647    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  53.8 
 
 
1033 aa  1082    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  38.69 
 
 
1058 aa  649    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  37.01 
 
 
1043 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  37.5 
 
 
1055 aa  673    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  35.75 
 
 
1052 aa  645    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  39.59 
 
 
1062 aa  701    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  36.93 
 
 
1055 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  37.25 
 
 
1065 aa  617  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  36.9 
 
 
1053 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  27.7 
 
 
993 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  43.27 
 
 
938 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  33.81 
 
 
905 aa  351  3e-95  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  39.71 
 
 
1287 aa  348  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  36.79 
 
 
1077 aa  347  7e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  35.47 
 
 
848 aa  342  2e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  38.26 
 
 
956 aa  335  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.87 
 
 
974 aa  330  1.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  37.74 
 
 
928 aa  324  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  31.69 
 
 
815 aa  320  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  31.92 
 
 
813 aa  312  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  30.25 
 
 
812 aa  312  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  27.11 
 
 
953 aa  308  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  27.11 
 
 
953 aa  308  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  30.62 
 
 
1149 aa  304  6.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  35.29 
 
 
967 aa  298  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  30.68 
 
 
946 aa  298  5e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  30.45 
 
 
952 aa  295  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  34.49 
 
 
979 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  34.36 
 
 
1418 aa  287  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.14 
 
 
979 aa  285  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  33.86 
 
 
987 aa  280  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  34.78 
 
 
1348 aa  277  7e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  30.1 
 
 
949 aa  268  5e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  32.56 
 
 
949 aa  264  8e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  36.46 
 
 
967 aa  250  8e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  30.86 
 
 
980 aa  247  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  33.18 
 
 
773 aa  192  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  31.58 
 
 
459 aa  157  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  32.24 
 
 
462 aa  154  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  31.39 
 
 
475 aa  153  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  29.61 
 
 
536 aa  146  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  30.98 
 
 
558 aa  145  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  32.03 
 
 
469 aa  139  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  28.29 
 
 
643 aa  132  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  31.79 
 
 
556 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  30.77 
 
 
629 aa  129  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  27.03 
 
 
385 aa  125  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  31.68 
 
 
606 aa  124  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  30.75 
 
 
524 aa  123  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  28.34 
 
 
581 aa  122  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  28.93 
 
 
590 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  30.37 
 
 
590 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  31 
 
 
607 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  28.93 
 
 
590 aa  119  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  31.21 
 
 
584 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  31.21 
 
 
584 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  31.21 
 
 
584 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  30.52 
 
 
602 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  30.92 
 
 
584 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  28.02 
 
 
398 aa  116  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  28.53 
 
 
560 aa  115  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  27.73 
 
 
560 aa  115  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  29.06 
 
 
560 aa  114  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  28.44 
 
 
560 aa  114  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  28.37 
 
 
590 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  29.6 
 
 
574 aa  112  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  27.9 
 
 
560 aa  112  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  28.41 
 
 
550 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  27.3 
 
 
560 aa  112  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  28.5 
 
 
760 aa  108  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  28.26 
 
 
760 aa  108  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  27.99 
 
 
761 aa  108  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  29.36 
 
 
580 aa  108  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  27.68 
 
 
811 aa  107  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  27.87 
 
 
580 aa  105  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  29.24 
 
 
579 aa  105  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  24.38 
 
 
706 aa  104  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  26.28 
 
 
860 aa  103  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  28.77 
 
 
585 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  28.65 
 
 
545 aa  102  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  27.67 
 
 
545 aa  101  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  27.95 
 
 
583 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  27.83 
 
 
584 aa  100  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>