More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2492 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  40.53 
 
 		 1042 aa  674    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  42.58 
 
 		 1041 aa  706    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  39.16 
 
 		 1017 aa  673    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  39.02 
 
 		 982 aa  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  39.25 
 
 		 1055 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  49.53 
 
 		 1065 aa  1010    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  43.42 
 
 		 1033 aa  670    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  37.75 
 
 		 1052 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 1066 aa  2169    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  38.62 
 
 		 1055 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  39.43 
 
 		 1051 aa  659    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  39.16 
 
 		 1063 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  42.15 
 
 		 1035 aa  697    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  43.78 
 
 		 1033 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  39.25 
 
 		 1033 aa  697    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  40.61 
 
 		 1031 aa  656    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  42.51 
 
 		 1029 aa  671    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  40.45 
 
 		 1042 aa  665    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  41.27 
 
 		 1043 aa  687    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  44.08 
 
 		 1062 aa  721    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  38.73 
 
 		 1055 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  38.69 
 
 		 1061 aa  635  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  39.18 
 
 		 1051 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  39.83 
 
 		 1028 aa  631  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  38.28 
 
 		 1058 aa  580  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  30.58 
 
 		 1053 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  28.18 
 
 		 993 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  32.81 
 
 		 938 aa  333  9e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  35.01 
 
 		 848 aa  329  1.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  27.21 
 
 		 952 aa  322  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  38.05 
 
 		 1287 aa  318  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  30.82 
 
 		 905 aa  313  1e-83  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  34.63 
 
 		 1077 aa  310  9e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  32.68 
 
 		 928 aa  308  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  31.96 
 
 		 956 aa  307  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  26.79 
 
 		 953 aa  307  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  26.79 
 
 		 953 aa  307  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.78 
 
 		 974 aa  296  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  32.61 
 
 		 813 aa  295  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  29.98 
 
 		 1149 aa  295  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  32.39 
 
 		 812 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  33.12 
 
 		 967 aa  289  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  29.57 
 
 		 949 aa  288  4e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  33.23 
 
 		 987 aa  281  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  27.15 
 
 		 946 aa  281  6e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.01 
 
 		 979 aa  278  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  35.27 
 
 		 1418 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  31.49 
 
 		 815 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  29.49 
 
 		 949 aa  275  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  35.22 
 
 		 979 aa  264  8e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  33.01 
 
 		 1348 aa  251  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  34.34 
 
 		 967 aa  228  6e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  30.24 
 
 		 980 aa  218  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  31.02 
 
 		 459 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  31.36 
 
 		 773 aa  158  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 475 aa  154  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  28.05 
 
 		 536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  32.35 
 
 		 550 aa  142  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  30.37 
 
 		 462 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  28.57 
 
 		 385 aa  135  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  33.24 
 
 		 469 aa  133  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  30.16 
 
 		 558 aa  128  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  29.97 
 
 		 524 aa  128  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 606 aa  125  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  32.64 
 
 		 607 aa  125  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  30.53 
 
 		 613 aa  124  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  30.3 
 
 		 545 aa  122  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  29.89 
 
 		 629 aa  122  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  29.95 
 
 		 545 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  30.03 
 
 		 545 aa  121  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  30.99 
 
 		 581 aa  121  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  30.29 
 
 		 569 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  28.46 
 
 		 586 aa  114  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  29.59 
 
 		 560 aa  113  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  27.61 
 
 		 574 aa  112  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  29.02 
 
 		 586 aa  112  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  28.91 
 
 		 804 aa  112  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  28.96 
 
 		 538 aa  112  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  29.79 
 
 		 560 aa  111  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  28.53 
 
 		 585 aa  111  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  27.76 
 
 		 586 aa  111  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  29.27 
 
 		 586 aa  110  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  29.27 
 
 		 586 aa  110  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  29.27 
 
 		 586 aa  110  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  29.29 
 
 		 560 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  29.74 
 
 		 586 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  26.65 
 
 		 585 aa  110  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  28.76 
 
 		 583 aa  110  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  29.74 
 
 		 586 aa  110  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  28.21 
 
 		 760 aa  109  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  29.74 
 
 		 586 aa  110  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  29.74 
 
 		 586 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  29.02 
 
 		 586 aa  109  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  29.02 
 
 		 586 aa  109  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  29.02 
 
 		 586 aa  109  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  28.21 
 
 		 760 aa  109  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  29.02 
 
 		 586 aa  109  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  31.73 
 
 		 556 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  29.49 
 
 		 586 aa  108  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  29.02 
 
 		 586 aa  108  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>