More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2726 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 580 aa  1210    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  72.93 
 
 		 590 aa  890    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  71.08 
 
 		 584 aa  871    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  73.4 
 
 		 579 aa  908    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  71.72 
 
 		 584 aa  872    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  71.08 
 
 		 584 aa  872    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  68.45 
 
 		 616 aa  844    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  82.87 
 
 		 580 aa  1004    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  73.1 
 
 		 590 aa  887    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  73.45 
 
 		 590 aa  890    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  70.09 
 
 		 583 aa  850    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  71.08 
 
 		 584 aa  872    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  77.04 
 
 		 580 aa  929    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  72.76 
 
 		 590 aa  889    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  71.77 
 
 		 602 aa  877    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  63.32 
 
 		 588 aa  761    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  52.32 
 
 		 586 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  52.32 
 
 		 586 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  52.32 
 
 		 586 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  52.32 
 
 		 586 aa  612  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  52.32 
 
 		 586 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  52.15 
 
 		 586 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  52.15 
 
 		 586 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  52.32 
 
 		 586 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  52.32 
 
 		 586 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  52.15 
 
 		 586 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  52.32 
 
 		 586 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  52.16 
 
 		 585 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  52.15 
 
 		 586 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  52.15 
 
 		 586 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  51.64 
 
 		 586 aa  609  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  51.11 
 
 		 591 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  50.77 
 
 		 586 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  49.4 
 
 		 586 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  50.43 
 
 		 585 aa  600  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  49.83 
 
 		 586 aa  599  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  50.35 
 
 		 585 aa  599  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  50.35 
 
 		 585 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  50.35 
 
 		 585 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  50.43 
 
 		 586 aa  597  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  48.64 
 
 		 597 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  49.57 
 
 		 583 aa  569  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  48.09 
 
 		 613 aa  566  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  48.53 
 
 		 583 aa  558  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.04 
 
 		 657 aa  558  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  48.17 
 
 		 574 aa  543  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  47.16 
 
 		 584 aa  542  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  33.07 
 
 		 678 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  31.22 
 
 		 545 aa  207  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  28.43 
 
 		 538 aa  207  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  31.21 
 
 		 569 aa  203  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  34.79 
 
 		 545 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  34.25 
 
 		 545 aa  200  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  30.15 
 
 		 550 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  32.7 
 
 		 629 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  30.38 
 
 		 581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  32.11 
 
 		 536 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  25.85 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  27.42 
 
 		 560 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  30.14 
 
 		 967 aa  130  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  30.16 
 
 		 606 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  26.88 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  30.37 
 
 		 607 aa  128  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  24.9 
 
 		 469 aa  126  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  30.48 
 
 		 848 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  27.13 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  26.88 
 
 		 560 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  27.15 
 
 		 560 aa  123  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  27.15 
 
 		 398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  29.1 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  27.15 
 
 		 560 aa  121  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  27.3 
 
 		 462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  25.82 
 
 		 560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  25 
 
 		 643 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11338  hypothetical protein  27.01 
 
 		 503 aa  115  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.75 
 
 		 504 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  29.68 
 
 		 993 aa  111  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  26.03 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  29.36 
 
 		 1063 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  27.17 
 
 		 1077 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  28.49 
 
 		 815 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  27.62 
 
 		 812 aa  107  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  28.65 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  27.75 
 
 		 813 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  29.57 
 
 		 1051 aa  105  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1302  putative helicase  26.74 
 
 		 516 aa  103  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  27.32 
 
 		 1287 aa  103  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  27.25 
 
 		 1348 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  28.91 
 
 		 558 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  29.26 
 
 		 1055 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  26.32 
 
 		 773 aa  101  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  26.85 
 
 		 1058 aa  101  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  25.86 
 
 		 524 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  27.35 
 
 		 556 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  26.58 
 
 		 1065 aa  99.8  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  28.21 
 
 		 1055 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  28.38 
 
 		 1055 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  26.68 
 
 		 787 aa  99  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  29.14 
 
 		 1418 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  24.88 
 
 		 706 aa  98.2  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>