More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2792 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 678 aa  1412    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  35.91 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  36.4 
 
 		 585 aa  276  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  36.4 
 
 		 585 aa  276  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  36.4 
 
 		 585 aa  276  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  36.2 
 
 		 597 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  34.12 
 
 		 585 aa  269  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  34.93 
 
 		 586 aa  267  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  35.32 
 
 		 586 aa  266  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  34.52 
 
 		 585 aa  266  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  34.52 
 
 		 586 aa  266  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  34.33 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  34.11 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  34.5 
 
 		 586 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  35.12 
 
 		 586 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  34.5 
 
 		 586 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  34.11 
 
 		 586 aa  264  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  34.13 
 
 		 586 aa  264  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  33.92 
 
 		 586 aa  263  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  33.92 
 
 		 586 aa  263  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  33.92 
 
 		 586 aa  263  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  34.31 
 
 		 586 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  34.5 
 
 		 586 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  34.33 
 
 		 586 aa  262  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  34.11 
 
 		 586 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  30.35 
 
 		 613 aa  258  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  34.92 
 
 		 579 aa  257  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.15 
 
 		 657 aa  254  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  34.31 
 
 		 591 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  34.58 
 
 		 583 aa  253  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  33.46 
 
 		 616 aa  252  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  34.49 
 
 		 583 aa  252  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  34.33 
 
 		 583 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  33.07 
 
 		 574 aa  249  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  34.06 
 
 		 580 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  32.75 
 
 		 602 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  33.46 
 
 		 590 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  33.07 
 
 		 590 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  33.46 
 
 		 590 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  33.53 
 
 		 588 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  33.07 
 
 		 580 aa  241  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  33.46 
 
 		 590 aa  241  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  32.36 
 
 		 584 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  32.43 
 
 		 584 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 580 aa  238  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  32.17 
 
 		 584 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  32.17 
 
 		 584 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  31.29 
 
 		 584 aa  229  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  31.53 
 
 		 538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  29.78 
 
 		 545 aa  150  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  31.96 
 
 		 569 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  32.02 
 
 		 545 aa  147  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  28.69 
 
 		 550 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  30.61 
 
 		 545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  28.65 
 
 		 560 aa  107  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  28.47 
 
 		 560 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  28.76 
 
 		 560 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  27.75 
 
 		 560 aa  104  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  28.53 
 
 		 560 aa  103  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  28.53 
 
 		 398 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  26.43 
 
 		 770 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  28.81 
 
 		 560 aa  103  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  26.8 
 
 		 558 aa  92.8  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  28.17 
 
 		 607 aa  91.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  26.98 
 
 		 581 aa  91.3  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  26.3 
 
 		 462 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  26.17 
 
 		 510 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  27.13 
 
 		 606 aa  88.6  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  23.51 
 
 		 706 aa  87.8  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  25.32 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  25.37 
 
 		 512 aa  85.5  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  24.41 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1025  type III restriction enzyme, res subunit  26.79 
 
 		 753 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  27.29 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  23.66 
 
 		 643 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  24.64 
 
 		 793 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  27.4 
 
 		 761 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  24.93 
 
 		 967 aa  82  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  25.06 
 
 		 907 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  24.94 
 
 		 459 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  26.55 
 
 		 629 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  24 
 
 		 796 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  26.12 
 
 		 967 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  24.72 
 
 		 791 aa  78.2  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  25.34 
 
 		 987 aa  77  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8690  putative helicase  25.19 
 
 		 469 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  25.4 
 
 		 1125 aa  76.6  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  23.16 
 
 		 812 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.52 
 
 		 974 aa  75.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  25.32 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  22.9 
 
 		 809 aa  74.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2422  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 1119 aa  74.3  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.567699  normal  0.274661 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  23.18 
 
 		 979 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  26.6 
 
 		 1058 aa  73.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  24.52 
 
 		 504 aa  72.4  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  24.46 
 
 		 790 aa  72.4  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  26.15 
 
 		 1035 aa  72  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  26.42 
 
 		 1042 aa  71.6  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 1287 aa  71.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>