More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2616 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 459 aa  956    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  42.51 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  39.79 
 
 		 462 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  40.38 
 
 		 475 aa  343  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  38.27 
 
 		 629 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.62 
 
 		 504 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  29.93 
 
 		 550 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  31.5 
 
 		 1066 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  29.59 
 
 		 607 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  28.16 
 
 		 538 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  30.72 
 
 		 993 aa  160  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  29.26 
 
 		 606 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  31.75 
 
 		 1033 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  29.46 
 
 		 536 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  31.64 
 
 		 848 aa  157  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  28.84 
 
 		 502 aa  156  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  31.5 
 
 		 1077 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  32.42 
 
 		 938 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  31.04 
 
 		 1033 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  30.06 
 
 		 773 aa  153  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  30.52 
 
 		 1033 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  31.86 
 
 		 1063 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  28.65 
 
 		 581 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  29.47 
 
 		 545 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  30.66 
 
 		 967 aa  149  8e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  29.44 
 
 		 545 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 569 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  29.94 
 
 		 1051 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  27.8 
 
 		 560 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  28.4 
 
 		 560 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  27.86 
 
 		 385 aa  147  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  31.2 
 
 		 1062 aa  147  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  30.31 
 
 		 1029 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  30.9 
 
 		 1287 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  30.21 
 
 		 979 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  26.65 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  29.49 
 
 		 1052 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  28.64 
 
 		 560 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  29.36 
 
 		 982 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  29.77 
 
 		 1028 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  27.32 
 
 		 560 aa  144  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  26.82 
 
 		 524 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  28.46 
 
 		 545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  28.06 
 
 		 1065 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  30.86 
 
 		 956 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  27.32 
 
 		 560 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  30.86 
 
 		 928 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  28.93 
 
 		 1041 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  29.13 
 
 		 1055 aa  136  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.85 
 
 		 1031 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  25.21 
 
 		 812 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  26.35 
 
 		 905 aa  134  3e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  29 
 
 		 813 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  27.3 
 
 		 1042 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  28.85 
 
 		 1055 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  28.85 
 
 		 1055 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  28.96 
 
 		 967 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  30.17 
 
 		 1035 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  26.95 
 
 		 1149 aa  131  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  28.42 
 
 		 1042 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  26.58 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  26.37 
 
 		 706 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  27.46 
 
 		 1053 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.79 
 
 		 979 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  27.57 
 
 		 1061 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  29.73 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  26.44 
 
 		 1051 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  28.08 
 
 		 583 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  29.56 
 
 		 1043 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  28.91 
 
 		 643 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.23 
 
 		 657 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  27 
 
 		 586 aa  127  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  28 
 
 		 583 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.71 
 
 		 974 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  28.26 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  26.76 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  26.75 
 
 		 586 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  29.34 
 
 		 1348 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  26.56 
 
 		 585 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  26.68 
 
 		 1017 aa  124  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  28.04 
 
 		 586 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  27.3 
 
 		 574 aa  124  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  28.04 
 
 		 586 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  28.04 
 
 		 586 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  27.36 
 
 		 586 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  27.33 
 
 		 815 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  28.04 
 
 		 586 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  27.93 
 
 		 586 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  27.36 
 
 		 987 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  27.16 
 
 		 591 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  27.07 
 
 		 584 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  26.67 
 
 		 586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  26.55 
 
 		 586 aa  121  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  26.55 
 
 		 586 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  25.38 
 
 		 949 aa  121  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  26.55 
 
 		 586 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  27.47 
 
 		 584 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  26.55 
 
 		 586 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  27.47 
 
 		 584 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  26.55 
 
 		 586 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>