More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8756 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  38.4 
 
 		 1041 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  38.69 
 
 		 982 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  37.3 
 
 		 1055 aa  646    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  36.18 
 
 		 1052 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  41.76 
 
 		 1033 aa  694    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  37.95 
 
 		 1051 aa  669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  41.32 
 
 		 1033 aa  690    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  37.94 
 
 		 1042 aa  654    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.97 
 
 		 1031 aa  843    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  38.2 
 
 		 1061 aa  684    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 1028 aa  2095    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  52.54 
 
 		 1063 aa  1026    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  44.89 
 
 		 1029 aa  798    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  52.08 
 
 		 1033 aa  1001    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  37.24 
 
 		 1055 aa  647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  53.71 
 
 		 1051 aa  1048    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  37.38 
 
 		 1043 aa  652    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  47.28 
 
 		 1035 aa  839    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  38.75 
 
 		 1062 aa  683    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  37.15 
 
 		 1055 aa  643    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  38.28 
 
 		 1042 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  36.72 
 
 		 1017 aa  627  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  38.74 
 
 		 1058 aa  628  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  39.83 
 
 		 1066 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  35.68 
 
 		 1065 aa  571  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  34.78 
 
 		 993 aa  381  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  34.63 
 
 		 1053 aa  357  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  31.34 
 
 		 905 aa  334  6e-90  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  39.75 
 
 		 938 aa  331  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  37.07 
 
 		 1077 aa  330  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.78 
 
 		 974 aa  325  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  37.37 
 
 		 956 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  37.52 
 
 		 928 aa  317  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  32.62 
 
 		 1149 aa  314  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  37.19 
 
 		 1287 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  32.16 
 
 		 848 aa  305  4.0000000000000003e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.36 
 
 		 979 aa  296  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  31.58 
 
 		 946 aa  291  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  26.63 
 
 		 952 aa  291  4e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  35.34 
 
 		 1418 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  31.52 
 
 		 953 aa  287  5.999999999999999e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  31.52 
 
 		 953 aa  287  5.999999999999999e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  32.31 
 
 		 967 aa  285  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  32.3 
 
 		 813 aa  282  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  35.34 
 
 		 1348 aa  282  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  35.33 
 
 		 987 aa  281  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  33.23 
 
 		 979 aa  267  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  29.56 
 
 		 812 aa  264  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  30.58 
 
 		 949 aa  259  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  32.19 
 
 		 949 aa  257  8e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  33.27 
 
 		 967 aa  249  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  28.82 
 
 		 980 aa  248  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  35.86 
 
 		 815 aa  231  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  36.49 
 
 		 773 aa  186  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  33.9 
 
 		 475 aa  157  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  33.74 
 
 		 462 aa  151  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  34.13 
 
 		 469 aa  145  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  29.77 
 
 		 459 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  32.05 
 
 		 581 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  29.7 
 
 		 536 aa  127  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  32.88 
 
 		 607 aa  127  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  32.38 
 
 		 606 aa  125  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  28.53 
 
 		 385 aa  122  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  28.05 
 
 		 558 aa  121  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  32.22 
 
 		 629 aa  119  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  29.91 
 
 		 560 aa  119  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  29.21 
 
 		 643 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  29.33 
 
 		 560 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  28.08 
 
 		 550 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  29.68 
 
 		 574 aa  110  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  27.79 
 
 		 560 aa  110  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  28.21 
 
 		 585 aa  108  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  30.55 
 
 		 556 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  27.84 
 
 		 583 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  30.46 
 
 		 524 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  28.12 
 
 		 583 aa  105  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  27.89 
 
 		 538 aa  105  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  28.48 
 
 		 398 aa  105  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  27.55 
 
 		 560 aa  104  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  28.95 
 
 		 545 aa  104  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  27.86 
 
 		 560 aa  103  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  30.73 
 
 		 586 aa  102  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  26.74 
 
 		 706 aa  102  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  28.01 
 
 		 560 aa  101  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  29.36 
 
 		 545 aa  101  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  28.53 
 
 		 585 aa  101  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  28.53 
 
 		 585 aa  101  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  29.65 
 
 		 545 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  28.26 
 
 		 585 aa  99.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  25.98 
 
 		 597 aa  99.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  27.22 
 
 		 586 aa  98.6  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  28.26 
 
 		 586 aa  98.6  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  28.61 
 
 		 583 aa  98.6  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  26.24 
 
 		 580 aa  98.2  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.21 
 
 		 657 aa  97.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  25.26 
 
 		 776 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  27.92 
 
 		 584 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  27.71 
 
 		 584 aa  97.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  27.92 
 
 		 602 aa  96.3  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  28.53 
 
 		 585 aa  96.3  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>